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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 根据遗传相似系数做聚类分析图
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嘻嘻哈哈2016

新虫 (著名写手)

[交流] 根据遗传相似系数做聚类分析图

本人做了160个品种的ssr分析，做个体聚类分析是由于品种太多，论文中一页放不下，想做成圆形的聚类分析图，求指导！！！不胜感激！！

根据遗传相似系数做聚类分析图


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lis007

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1楼 2017-01-23 22:31:16
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lis007

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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楼主你好，我也是做聚类分析的。想请教您一个实验方法中具体的问题，得到PAGE图之后如何读取条带信息生成聚类分析要的0-1数据矩阵表，是软件读取，还是人工用尺子比对读取，在读取过程中是每一个条带都记录还是只读取主条带？我主要是用聚类分析样品后进行田间基因育种的指导。
希望您百忙之中回复我，将不胜感激。谢谢！
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2楼2017-03-14 10:43:56
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xmcltwyk

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
MEGA5里可以在不同的聚类图之间转换

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3楼2017-03-14 11:12:05
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zyzhangyun

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问，您用的什么软件进行的聚类分析，我做的事80几个样品的SSR分析。谢谢
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4楼2018-01-03 11:39:32
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嘻嘻哈哈2016

新虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zyzhangyun at 2018-01-03 11:39:32
请问，您用的什么软件进行的聚类分析，我做的事80几个样品的SSR分析。谢谢

ntsys 抱歉 回复晚了

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5楼2018-04-22 09:23:06
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嘻嘻哈哈2016

新虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xmcltwyk at 2017-03-14 11:12:05
MEGA5里可以在不同的聚类图之间转换

求指导！

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6楼2018-04-22 09:23:27
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穆远life

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lis007 at 2017-03-14 10:43:56
楼主你好，我也是做聚类分析的。想请教您一个实验方法中具体的问题，得到PAGE图之后如何读取条带信息生成聚类分析要的0-1数据矩阵表，是软件读取，还是人工用尺子比对读取，在读取过程中是每一个条带都记录还是只读 ...

这个简单。
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7楼2019-08-10 22:26:49
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