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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » western 和考染找到了目的蛋白条带，可是质谱搜库为什么搜不到呢
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jiafeijiafei

金虫 (小有名气)

[求助] western 和考染找到了目的蛋白条带，可是质谱搜库为什么搜不到呢 已有2人参与

求助各位大神，我做蛋白质翻译后修饰，现在把蛋白用IP实验拉出来后，用western blot实验和考染都进行了验证，并找到了条带，可是我胶内酶切进样，软件进行搜库，却没有找到目的蛋白，这是为什么呢？
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1楼 2017-01-23 21:45:08
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
兔子，你的图呢？
使用高质量的质谱级蛋白酶才行，或者数据库的物种不对。
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2楼2017-01-25 11:01:25
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jiafeijiafei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2017-01-25 11:01:25
兔子，你的图呢？
使用高质量的质谱级蛋白酶才行，或者数据库的物种不对。

亲，我用的是progema的蛋白酶，数据库是uniprot上下载的经验证过的human的

发自小木虫Android客户端
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3楼2017-01-26 07:39:26
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timblake

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

是不是你的目的蛋白的条带太弱？你提高下IP蛋白的量，run胶之后确定能看到目的条带，再切胶，trypsin酶切试试。
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4楼2017-06-20 15:19:21
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abin12345

新虫 (正式写手)
请问楼主你这个解决了没有
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5楼2018-12-05 16:12:14
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