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jiafeijiafei

金虫 (小有名气)

[求助] western 和考染找到了目的蛋白条带,可是质谱搜库为什么搜不到呢 已有2人参与

求助各位大神,我做蛋白质翻译后修饰,现在把蛋白用IP实验拉出来后,用western blot实验和考染都进行了验证,并找到了条带,可是我胶内酶切进样,软件进行搜库,却没有找到目的蛋白,这是为什么呢?
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
兔子,你的图呢?
使用高质量的质谱级蛋白酶才行,或者数据库的物种不对。
2楼2017-01-25 11:01:25
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jiafeijiafei

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2017-01-25 11:01:25
兔子,你的图呢?
使用高质量的质谱级蛋白酶才行,或者数据库的物种不对。

亲,我用的是progema的蛋白酶,数据库是uniprot上下载的经验证过的human的

发自小木虫Android客户端
3楼2017-01-26 07:39:26
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timblake

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

是不是你的目的蛋白的条带太弱?你提高下IP蛋白的量,run胶之后确定能看到目的条带,再切胶,trypsin酶切试试。
4楼2017-06-20 15:19:21
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abin12345

新虫 (正式写手)

请问楼主你这个解决了没有
5楼2018-12-05 16:12:14
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