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anyipeng

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】ATK计算出错

请教:ATK计算出错,高手指点如何解决,谢谢:

mulliken_population = calculateMullikenPopulation(self_consistent_calculation = scf)
NLTypeError: The population must contain non-negative numbers only.
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zdhlover

荣誉版主 (职业作家)

小木虫之莲花佛

★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+3,VIP+0):thanks
anyipeng(金币+1,VIP+0):感谢
估计是你之前的SCF有问题,因为计算轨道占据的时候,轨道占据数也就是四个量子数中L必须为正值。
2楼2008-12-15 09:42:02
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anyipeng

金虫 (小有名气)

谢谢!!!!!
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3楼2008-12-15 16:19:46
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anyipeng

金虫 (小有名气)

谢谢!!!!!!!!!
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4楼2008-12-15 16:20:36
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Rosen-luo

铜虫 (初入文坛)

★ ★
zdhlover(金币+2,VIP+0):多谢,欢迎常来讨论啊
这个问题我以前也碰到过,通过调整结构比如与电极接触距离,健角的优化等可以避免,大部分这类问题是因为没有进行结构优化所致。
5楼2008-12-18 09:53:33
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anyipeng

金虫 (小有名气)

哦,谢谢,
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6楼2008-12-18 11:20:04
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Rosen-luo

铜虫 (初入文坛)

★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励讨论
这个问题,我昨天在quanturmwise的官方论坛上帮你问了一下,得到的答案跟我之前说的有些相同,也有些我之前没想到的补充:一个是结构优化的问题,
The reason for the error is that the system has converged to some unphysical state. This is either a geometry issue or insufficient parameters.
另一个原因是跟设置参数有关,比如电极厚度、在BZ的撒点有关,电极不够厚时会有电极之间的静电相互作用,为了屏蔽这种得加大电极的距离,因为表面格林函数的计算时是基于ATK的一个假设的:它只考虑最近邻单胞的作用,如果电极单胞太小的话,无法屏蔽它与更多单胞产生作用,内部的电子会产生散射,就会产生很多非物理的结果。
Second, regarding the problem of converging the system to a physical state: I suggest using at least 6 layers of Pt atoms in the electrode instead of 3. Cf.
Also, the system is quite small in the XY plane, and hence a larger k-point sampling than (2x2) is advisable.
7楼2008-12-19 13:39:54
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anyipeng

金虫 (小有名气)

多谢Rosen-luo
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8楼2008-12-19 20:57:22
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zoeinnj

金虫 (正式写手)

我也学习了
9楼2009-09-09 07:52:04
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