24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 824  |  回复: 0

zj9452

铜虫 (初入文坛)

[求助] 求将RNAseq根据注释的TSS排成列表

已经有bedGraph了, 由于是做NETseq,想要看在TSS的相对位置。如何把这样的数据:

chr       5 start   3 end        score      
chr1 3054909 3054910  0.283372

转化成X=position around TSS,Y=sum score of reads,如这样:

gene  -5 -4 -3 -2 -1 +1 +2 +3 +4 +5
abc    0    0   1  2  3  4   6    4   2    1

(最好是可以用r或者在unix下下载单独的软件处理)
另求RNA-seq数据处理的教程,新手自学,十分辛苦,万分感谢,各位帮助!
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zj9452 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 271求调剂 +24 2261744733 2026-04-11 27/1350 2026-04-13 11:17 by 紫曦紫棋
[考研] 297求调剂 +18 ORCHID1 2026-04-10 19/950 2026-04-13 09:21 by lhj2009
[考研] 271求调剂 +23 2261744733 2026-04-11 23/1150 2026-04-13 08:48 by 学zh
[考研] 0860004 求调剂 309分 +9 Yin DY 2026-04-08 9/450 2026-04-11 22:55 by dongdian1
[考研] 本人女孩 +7 吼吼, 2026-04-10 9/450 2026-04-11 14:45 by ACS Nano——
[考研] 085410 273分调剂 +4 X1999 2026-04-09 4/200 2026-04-11 13:05 by pies112
[考研] 工科273调剂 +6 X1999 2026-04-09 7/350 2026-04-11 10:23 by zhq0425
[考研] 342电子信息专硕求调剂 +9 你让我怎么荔枝 2026-04-10 10/500 2026-04-11 08:33 by zhq0425
[考研] 考研调剂 +26 硕星赴 2026-04-09 27/1350 2026-04-10 22:24 by 猪会飞
[考研] 求调剂 +5 不会飞的鱼@ 2026-04-10 5/250 2026-04-10 19:07 by chemisry
[考研] 一志愿鲁东大学071000生物学学硕初试分数276求调剂 +20 慕绝cc 2026-04-09 24/1200 2026-04-10 10:22 by xujun0624
[论文投稿] 求助文献原文 10+3 18500821399 2026-04-08 3/150 2026-04-09 16:56 by 北京莱茵润色
[考研] 283电子信息求调剂 +4 三石WL 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:21 by wp06
[考研] 一志愿华南师范大学0702物理学305调剂 +4 念常安 2026-04-07 6/300 2026-04-08 22:53 by bljnqdcc
[考研] 软件工程求调剂22软工296分求调剂,接受跨调 +4 yangchen2017 2026-04-08 5/250 2026-04-08 21:56 by 土木硕士招生
[考研] 287求调剂 +6 Fnhc 2026-04-07 6/300 2026-04-08 10:05 by xingguangj
[考研] 307求调剂 +3 Youth@@ 2026-04-07 3/150 2026-04-07 22:00 by hemengdong
[考研] 318求调剂 +5 李青山山山 2026-04-07 5/250 2026-04-07 18:24 by 蓝云思雨
[考研] 287分求调剂 有专利国奖一志愿哈工大085406 +6 白易辰 2026-04-06 7/350 2026-04-06 22:46 by 875465
[考研] 材料调剂 +5 小刘同学吖吖 2026-04-06 5/250 2026-04-06 18:34 by sherry_1901
信息提示
请填处理意见