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求将RNAseq根据注释的TSS排成列表
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已经有bedGraph了, 由于是做NETseq,想要看在TSS的相对位置。如何把这样的数据: chr 5 start 3 end score chr1 3054909 3054910 0.283372 转化成X=position around TSS,Y=sum score of reads,如这样: gene -5 -4 -3 -2 -1 +1 +2 +3 +4 +5 abc 0 0 1 2 3 4 6 4 2 1 (最好是可以用r或者在unix下下载单独的软件处理) 另求RNA-seq数据处理的教程,新手自学,十分辛苦,万分感谢,各位帮助! |
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