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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】Linux下安装Gaussian03
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nwwolfchj

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】Linux下安装Gaussian03

有在Linux下安装Gaussian03成功的例子，能详细的讲解一下嘛？
我刚装了ubutun玩不起来，好急人哦?
  详细的流程，命令等等写全点，我是刚学linux的菜鸟，只要能安装上计算起来就可以了。

[ Last edited by erylingjet on 2008-12-15 at 15:42 ]
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1楼 2008-12-14 16:50:10
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛，狼的耳朵，豹的速 ...
没装过，你请别人装吧！这个东西好浪费时间的
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的，轻易地放弃了不该放弃的……
2楼2008-12-14 17:44:50
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cysqxr

木虫 (小有名气)
★ ★
erylingjet(金币+2,VIP+0):欢迎交流
请问你是做 源程序编译安装  还是二进制程序安装。
linux下安装，主要是设置环境变量。手册上写的有。
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3楼2008-12-14 21:29:02
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nwwolfchj

金虫 (正式写手)

您好

我不知道，我是从网上下载下来的，应该是源程序吧？有什么区别？
反正里面一堆东西，就像XP下的一样。
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4楼2008-12-15 20:22:58
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superfan

至尊木虫 (著名写手)

耕耘者
wo shezhi chenggong guo
wo xiazai de shi bianyihao de .

[ Last edited by superfan on 2008-12-15 at 20:49 ]
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5楼2008-12-15 20:48:18
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wgpig

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+5,VIP+0):高手常来
nwwolfchj(金币+2,VIP+0):谢谢！谢谢，我尝试一下！
这个应该有不少人写过了。放狗就可以找到。
下面是我用的，你把你的改成相应的路径。
1）建立一个gauss.sh文件如下。
#! /bin/sh

g03root=/cluster3/gaussian
GAUSS_SCRDIR=.

export g03root GAUSS_SCRDIR

#LD_LIBRARY_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}:/cluster3/gaussian/g03

if [ -z "${LD_LIBRARY_PATH}" ]
then
    LD_LIBRARY_PATH="/cluster3/gaussian/g03"; export LD_LIBRARY_PATH
else
    LD_LIBRARY_PATH="/cluster3/gaussian/g03:${LD_LIBRARY_PATH}"; export LD_LIBRARY_PATH
fi


source $g03root/g03/bsd/g03.profil

2）
然后在~/.bash_profile文件中source 这个文件
source gauss.sh

[ Last edited by wgpig on 2008-12-15 at 21:56 ]
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6楼2008-12-15 21:16:34
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wgpig

木虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢补充
nwwolfchj(金币+1,VIP+0):感谢，那我的就是二进制的了，楼上说的理论上应该可以是吧。
引用回帖:
Originally posted by yyx19840628 at 2008-12-14 17:44:
没装过，你请别人装吧！这个东西好浪费时间的

98以后的中国不出售源码。
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7楼2008-12-15 22:04:07
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superfan

至尊木虫 (著名写手)

耕耘者
★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论！
引用回帖:
Originally posted by wgpig at 2008-12-15 22:04:


98以后的中国不出售源码。

看到的都是编译好的！
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8楼2008-12-17 22:44:01
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wgpig

木虫 (小有名气)
★
jghe(金币+1,VIP+0):感谢你参与讨论！
引用回帖:
Originally posted by superfan at 2008-12-17 22:44:

看到的都是编译好的！

国外买也很贵。
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9楼2008-12-18 09:44:45
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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州
★ ★ ★
jghe(金币+3,VIP+0):感谢你参与讨论！
之前写过一个，放到我的邮箱里面
用户名：bay__gulf618@2008.sina.com
密码   ：123456
入站   ：http://mail.2008.sina.com.cn/index.html

2 编辑.bashrc文件。
用一个文本编辑器打开你的home下的.bashrc 文件，ubuntu下的vi ，不好用，新手不推荐用，我有一个.vimrc文件，如果你不知道怎么对这个文件修改，可以直接用我的附件里的.vimrc覆盖你home下的文件，你的 vi 会非常好用，言归正传，在你的.bashrc 文件最后加上这么几行
##################################################################
# for Gaussian.03.C02
G03ROOT=/home/userid/g03
GAUSS_EXEDIR=$G03ROOT
GAUSS_SCRDIR=/tmp/userid/g03
LD_LIBRARY_PATH=$G03ROOT/:$LD_LIBRARY_PATH
PATH=$G03ROOT/:$PATH
export G03ROOT GAUSS_EXEDIR GAUSS_SCRDIR LD_LIBRARY_PATH PATH
##################################################################
带下划线加粗的地方要根据自己情况修改。

3 重启bash，当然不需要让你的机器重启。输入bash，或是再打开一个窗口就可以了。

4 win 下生成的*.gjf 文件因为格式问题不能直接使用，需要用dos2unix这个小工具转一下:
dos2unix *.gjf

5 运行g03 有两种方式。
a) g03 foo.gjf，会生成一个foo.log文件
b) g03 < foo.gjf，会把输出放到屏幕上，可以用输出重定向。g03 < foo.gjf > foo.log
有地方说linux 下g03 的输入文件后缀名为.com，没有不要，linux下文件不区分后缀名。

6 有时会有这样的问题，开机后/tmp/userid/g03文件夹消失了，需要手工建一个才能用。

7 有一个脚本很简单可是功能很大,可以实现批处理
#!/bin/bash
for i in *.gjf
do
g03 < ${i} > ${i}.log
done
###############

有问题仔细读一下输出文件，它给出的信息还是很多的，
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10楼2008-12-28 12:46:30
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