应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 网络生活区 » 有奖问答 » 学术帮助 » 用sybyl x2.0进行分子对接 对接后出现问题
31/1返回列表
查看: 1584  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

薛稳来kk

新虫 (初入文坛)

[求助] 用sybyl x2.0进行分子对接 对接后出现问题

正常情况下，用pdb数据库蛋白配体和原型分子对接后出现如图一。
但是，如果不用pdb数据库中提取的蛋白配体，而是用自己敲进去的分子就会出现这样的问题：分子表单丢失名字或结构。如图五。
这种情况怎么处理呢？

用sybyl x2.0进行分子对接   对接后出现问题
图一   对接正确.png


用sybyl x2.0进行分子对接   对接后出现问题-1
图二  自己敲的分子.png


用sybyl x2.0进行分子对接   对接后出现问题-2
图三   .png


用sybyl x2.0进行分子对接   对接后出现问题-3
图四  对接2.png


用sybyl x2.0进行分子对接   对接后出现问题-4
图五  自己敲的分子 .png
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2017-01-12 22:09:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

公尚过001

新虫 (初入文坛)
你首先需要让你的小分子和蛋白进行对接计算，确定小分子在蛋白空腔中的位置和构象，然后可以用导入相关软件研究分子和蛋白的作用关系

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
2楼2017-01-13 12:48:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

薛稳来kk

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 公尚过001 at 2017-01-13 12:48:06
你首先需要让你的小分子和蛋白进行对接计算，确定小分子在蛋白空腔中的位置和构象，然后可以用导入相关软件研究分子和蛋白的作用关系

小分子库和蛋白质都准备好了，不过蛋白和小分子的作用关系没有，因为我就是要做出这个东西来。现在是在小分子尝试对接的过程出现了问题

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2017-01-15 09:24:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 薛稳来kk 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭