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流火七月

新虫 (小有名气)

[交流] 求助无定型晶胞的建立

参照MS的例子建立无定型晶胞求扩散系数,在动画播放的步骤里,两种结构都在动,即吸附质和吸附剂都在动,这在实际的扩散中是正常的嘛?

按照例子中的步骤,分别建立了自己课题所需的吸附剂和吸附质,在建立无定型晶胞前,Minimizer时,使用compass立场才可以使吸附质最小化成功,cvff立场可以使吸附剂最小化成功,但是看见小木虫上有人提过,立场的选择要统一,所以在建立无定型晶胞时,如预期的一般,不能建立成功
请教各位大神,我该作何调整呢?
另外需要说明的是,我给自己的吸附质和吸附剂赋予了电荷,这是不是也有影响呢?

我的目的是求扩散系数,模拟吸附质在吸附剂中的扩散路径,现在没有什么思路,希望大家在文献或思路方面指导一下,若此路不通,可有其他路可走?
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