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傻鸽鸽

新虫 (初入文坛)

[求助] 氨基酸序列一对多比对 已有1人参与

怎么做氨基酸序列的一对多比对呢?用什么软件,具体的方法是什么,求教,谢谢!
30条短序列与一条长序列比较?
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hch123

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
silicare: 金币+10, MolEPI+1, 应助指数+1, 谢谢参与 2017-01-13 09:40:17
这个Vector NTI 里面可以做的,可以做出个类似于进化树的感觉

1:打开Vectro NTI,点击Aligen会跳出一个新的对话框。

2:选择open New aligen winord

3:直接把序列黏贴在右上角框内,会让你选择你黏贴的是核苷酸序列还是氨基酸序列。选择氨基酸序列就好。

4:把你要比对的序列全部黏进去,最好用FAST格式,这样可以命名。你的序列比较多,可以先

     以FAST格式放在同一个TXT文档里面,然后用add files 一起添加。

5:选中你要比对的序列, 然后点击Aligen里面的Aligen selectend sequence 就会比对了。

6:如果你想导出这些比对结果的话,可以右击你的比对序列,选择Print Preview ,选择打印,以PDF的格式保存出来。
脚踏实地:遇一个,学一个,会一个。。。
3楼2017-01-09 14:50:11
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淘七九懒

铁杆木虫 (著名写手)

Bioedit 这个软件可以的,你可以去学习下

发自小木虫IOS客户端
2楼2017-01-09 14:31:45
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