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转录组数据分析中遇到的几个问题
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最近在用公共转录组数据做分析，有几个问题想请教下： for example: 1. geneid => Gene identifier as reported in the cDNA model fasta file used in alignment 2. score => Number of mapped reads to this gene per 1000bp 3. alternatives => Number of alternative mappings reported by aligner, normalized to total number of mappings GeneID RPK Alternative 271114 687.831 0.751648 134883 NA NA 85242 1.001 1 1. 怎么理解这个 alternatives? 2. 基因 85242是否在转录水平有表达，那个Alternative =1是否有特殊意义 |
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