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关于lammps中data文件格式的问题 已有2人参与
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刚开始学lammps,犯了几个错误,在此总结。 1. 关于data文件的格式问题 bonds的数目本来是35178,结果写成35718,运行报错 “Error:Unknown Identifier in data file : 538 5 381 377 380” 一行有5个数据,对应的是Angles数据的错误。 2. 在packmol中堆积分子指定的boxsize为 0 101 xlo xhi 0 101 ylo yhi 0 101 zlo zhi 但是在input.data 中又写成 0 75 xlo xhi 0 75 ylo yhi 0 75 zlo zhi 运行时报错“out of range atoms...”,前后不一致出现错误。 出现错误时的处理方法: 1.首先根据错误信息,定位错误点是在Atoms,Bonds,Angles哪个区块,核对文件开头的原子数目和键数目等信息是否与 列表给出的一致。我个人的情况,一般此类错误与书写的数目出错有关。 2.保证格式正确,时时参看data format的说明文档,哪些字段要写,哪里要空行等等。 http://lammps.sandia.gov/doc/2001/data_format.html |
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cahndengbin
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