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MLST测序结果的数据处理
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小摆搁
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MLST测序结果的数据处理
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各位大神,我最近在做沙门氏菌的mlst分型,样品已经拿去测序了,可是测序回来的结果我不会分析,请问哪位大神可以给我教下具体如何处理这测序结果的数据,以及构建进化树呀,小弟在此谢过啦
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DOTA-GPC3肽(CAS 3066439-94-6):双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
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1楼
2016-12-28 22:42:32
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草莓欧妮
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【答案】应助回帖
引用回帖:
1楼
:
Originally posted by
小摆搁
at 2016-12-28 22:42:32
各位大神,我最近在做沙门氏菌的mlst分型,样品已经拿去测序了,可是测序回来的结果我不会分析,请问哪位大神可以给我教下具体如何处理这测序结果的数据,以及构建进化树呀,小弟在此谢过啦
你好,我想请问你送去哪里测序的…
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2楼
2017-06-07 09:09:09
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大大莉微笑
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专业: 兽医药理学与毒理学
那测序回来的序列直接和数据库比对呀。就可以得到相应的ST型了
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2017-12-24 18:12:16
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专业: 兽医药理学与毒理学
以前我是在这个网站做的http://mlst.warwick.ac.uk/mlst/dbs/,今天又做的时候发现网站更新了,序列不能识别,我也正愁怎么处理
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4楼
2018-01-18 13:10:52
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请问一下你是做双向测序吗?单项可以吗?你的问题解决了没?我也在做分型,但是不会处理数据,求帮助啊
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5楼
2018-02-03 01:47:23
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愚昧的土豆
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3楼
:
Originally posted by
大大莉微笑
at 2017-12-24 18:12:16
那测序回来的序列直接和数据库比对呀。就可以得到相应的ST型了
您好,我做的是纹带棒状杆菌的序列分型,但是在MLST网站里没有这个菌,请问我该如何获得ST
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6楼
2020-09-03 09:52:10
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6楼
:
Originally posted by
愚昧的土豆
at 2020-09-03 09:52:10
您好,我做的是纹带棒状杆菌的序列分型,但是在MLST网站里没有这个菌,请问我该如何获得ST...
请问你的问题解决了吗?我也是MLST网站里没有的菌,请问如何获得ST
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7楼
2023-03-20 10:29:16
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