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小摆搁

铜虫 (初入文坛)

[求助] MLST测序结果的数据处理 已有1人参与

各位大神,我最近在做沙门氏菌的mlst分型,样品已经拿去测序了,可是测序回来的结果我不会分析,请问哪位大神可以给我教下具体如何处理这测序结果的数据,以及构建进化树呀,小弟在此谢过啦
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草莓欧妮

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
1楼: Originally posted by 小摆搁 at 2016-12-28 22:42:32
各位大神,我最近在做沙门氏菌的mlst分型,样品已经拿去测序了,可是测序回来的结果我不会分析,请问哪位大神可以给我教下具体如何处理这测序结果的数据,以及构建进化树呀,小弟在此谢过啦

你好,我想请问你送去哪里测序的…

发自小木虫IOS客户端
2楼2017-06-07 09:09:09
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大大莉微笑

新虫 (小有名气)

那测序回来的序列直接和数据库比对呀。就可以得到相应的ST型了

发自小木虫IOS客户端
3楼2017-12-24 18:12:16
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lixiaoshen

铁虫 (初入文坛)

以前我是在这个网站做的http://mlst.warwick.ac.uk/mlst/dbs/,今天又做的时候发现网站更新了,序列不能识别,我也正愁怎么处理
4楼2018-01-18 13:10:52
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休止符㏄

新虫 (初入文坛)

请问一下你是做双向测序吗?单项可以吗?你的问题解决了没?我也在做分型,但是不会处理数据,求帮助啊

发自小木虫Android客户端
5楼2018-02-03 01:47:23
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愚昧的土豆

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 大大莉微笑 at 2017-12-24 18:12:16
那测序回来的序列直接和数据库比对呀。就可以得到相应的ST型了

您好,我做的是纹带棒状杆菌的序列分型,但是在MLST网站里没有这个菌,请问我该如何获得ST
6楼2020-09-03 09:52:10
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回头再说

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 愚昧的土豆 at 2020-09-03 09:52:10
您好,我做的是纹带棒状杆菌的序列分型,但是在MLST网站里没有这个菌,请问我该如何获得ST...

请问你的问题解决了吗?我也是MLST网站里没有的菌,请问如何获得ST
7楼2023-03-20 10:29:16
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