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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » MLST测序结果的数据处理
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小摆搁

铜虫 (初入文坛)

[求助] MLST测序结果的数据处理 已有1人参与

各位大神，我最近在做沙门氏菌的mlst分型，样品已经拿去测序了，可是测序回来的结果我不会分析，请问哪位大神可以给我教下具体如何处理这测序结果的数据，以及构建进化树呀，小弟在此谢过啦
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1楼 2016-12-28 22:42:32
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草莓欧妮

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
1楼: Originally posted by 小摆搁 at 2016-12-28 22:42:32
各位大神，我最近在做沙门氏菌的mlst分型，样品已经拿去测序了，可是测序回来的结果我不会分析，请问哪位大神可以给我教下具体如何处理这测序结果的数据，以及构建进化树呀，小弟在此谢过啦

你好，我想请问你送去哪里测序的…

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2楼2017-06-07 09:09:09
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大大莉微笑

新虫 (小有名气)
那测序回来的序列直接和数据库比对呀。就可以得到相应的ST型了

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3楼2017-12-24 18:12:16
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lixiaoshen

铁虫 (初入文坛)
以前我是在这个网站做的http://mlst.warwick.ac.uk/mlst/dbs/，今天又做的时候发现网站更新了，序列不能识别，我也正愁怎么处理
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4楼2018-01-18 13:10:52
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休止符㏄

新虫 (初入文坛)
请问一下你是做双向测序吗？单项可以吗？你的问题解决了没？我也在做分型，但是不会处理数据，求帮助啊

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5楼2018-02-03 01:47:23
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愚昧的土豆

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 大大莉微笑 at 2017-12-24 18:12:16
那测序回来的序列直接和数据库比对呀。就可以得到相应的ST型了

您好，我做的是纹带棒状杆菌的序列分型，但是在MLST网站里没有这个菌，请问我该如何获得ST
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6楼2020-09-03 09:52:10
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回头再说

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 愚昧的土豆 at 2020-09-03 09:52:10
您好，我做的是纹带棒状杆菌的序列分型，但是在MLST网站里没有这个菌，请问我该如何获得ST...

请问你的问题解决了吗？我也是MLST网站里没有的菌，请问如何获得ST
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7楼2023-03-20 10:29:16
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