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YXS-YM

银虫 (初入文坛)

[求助] CDS序列求助 已有1人参与

前辈们好！我想问一下为什么我通过Gene bank里mRNA查BRCA-1基因的CDS序列，却看见很多不同的mRNA，进而看到不同的CDS序列，CDS序列不应该是一样的吗？还是说这种查找方法是错的？请各位前辈帮帮忙，谢谢了！
附带网页链接         https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuc ... amp;amp;strand=true
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1楼 2016-12-28 20:34:51
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xingh119

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
2楼2016-12-28 21:46:58
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i19870503

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有不同的转录本，所以对应不同的cds

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3楼2016-12-30 07:05:23
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YXS-YM

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xingh119 at 2016-12-28 21:46:58
同一物种吗？同一物种不同个体也有所不同啊，所以提交到NCBI bank 里面序列有差异

就是人的CDS序列，我应该怎么选择呢？
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4楼2016-12-31 12:05:13
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YXS-YM

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by i19870503 at 2016-12-30 07:05:23
有不同的转录本，所以对应不同的cds

如果我想克隆这段基因来表达蛋白，我应该怎么选择它不同的转录本呢？
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5楼2016-12-31 12:06:36
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i19870503

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by YXS-YM at 2016-12-31 12:06:36
如果我想克隆这段基因来表达蛋白，我应该怎么选择它不同的转录本呢？...

蛋白的如果直接考虑full length的话就选择最全的转录本，ncbi可以直接在genome browser上获取

发自小木虫IOS客户端
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6楼2016-12-31 19:46:04
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