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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 细菌新种或者新属的鉴定
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SunnyDeViLs

新虫 (初入文坛)

[求助] 细菌新种或者新属的鉴定 已有3人参与

在我们实验室有可能分离出来一个新的属的细菌，请问下一步具体确认的流程是什么，比如需要送到外面测的和自己能做的工作？非常着急，在这里先谢谢广大虫子了！（PS：16sRDNA已经做过，TA克隆在做）
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1楼 2016-12-24 11:23:18
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

416114799

至尊木虫 (知名作家)
帮你纠正一下，是16S rRNA。此外，建议直接全基因测序，草图三千左右，精细图谱也就五千

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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
2楼2016-12-25 14:47:06
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如此笨蛋dp

新虫 (初入文坛)
7楼，想问一下，你跑甲基萘醌用的是什么方法，跑液相吗？还是跑的液质，可不可以分享下方法，最近有几株，之前只做古菌脂质体，细菌的不太了解

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9楼2018-05-29 18:54:09
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普通回帖

二十一业

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
联系国家微生物菌种保藏中心咨询，比如ACCC等
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3楼2016-12-26 10:05:02
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Shorewind

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 416114799 at 2016-12-25 14:47:06
帮你纠正一下，是16S rRNA。此外，建议直接全基因测序，草图三千左右，精细图谱也就五千

请教下，16SrDNA和16SrRNA都能见于文献，因为“此DNA”就是“此RNA”的模板，所以二者并无不同，虽然前者是核区的，后者是核糖体的。为何层主要纠正为16SrRNA呢？
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4楼2017-04-13 10:02:39
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xmliuyang

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by Shorewind at 2017-04-13 10:02:39
请教下，16SrDNA和16SrRNA都能见于文献，因为“此DNA”就是“此RNA”的模板，所以二者并无不同，虽然前者是核区的，后者是核糖体的。为何层主要纠正为16SrRNA呢？...

16S rDNA的说法是正确的，因为我们一般是在DNA水平进行分析的，另外，如果用RNA描述的话，是16S rRNA基因序列。英文文章中一般是16S rRNA gene sequence。如有问题请多交流～

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5楼2017-04-24 21:33:41
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lusandanooo

银虫 (小有名气)
可以先做生理生化，然后鉴定到种得全基因组测序，再分析基因组

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毕了业真开心嘻嘻嘻嘻嘻
6楼2017-04-24 22:41:18
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)
先找IJSEM上的论文仔细研读一下，有问题可以私信
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7楼2017-04-24 23:52:43
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大侠左左木

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by liuhaolin3 at 2017-04-24 23:52:43
先找IJSEM上的论文仔细研读一下，有问题可以私信

你好，最近我也在做新种鉴定，想请问下甲基萘醌的醌型是根据与之相似的菌株来判断吗？如果买不到相似菌株，文献也没有报道，是不是就需要买不同的醌型跑标样来看？谢谢啦~！
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8楼2017-06-15 14:48:28
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784065645

新虫 (初入文坛)
可以参考IJCEM期刊上面的鉴定分类比较
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10楼2018-05-30 10:11:14
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