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_Unicorn

铁虫 (小有名气)

[求助] 仅仅知道蛋白的氨基酸序列 如何得知cDNA核酸序列

在MPMI上找到了一篇与自己研究课题相关的文献 , 由于那篇文章挖掘了新的effector,而且做的龄期表达,所以很想找些其中
感觉很不错的effector做做Y2H。但是要命的是文中没有给出NCBI上的序列号,所以无从下手后来又在另一篇文献里面发现国内一个
同行大牛找到了编号相同的序列,欣喜若狂,终于知道了序列被上传到了其他的数据库中,但是在那个数据库里面,只有蛋白序列,
琢磨了半天也没找到相关的核酸序列。
  想用氨基酸序列反推 但是其实太难了 ,用ncbi上的BLAST 来找蛋白与转录组的blast 试了几个数据库的类似蛋白都没结果。
  小老板说可以找师兄的朋友找一下,但是师兄的朋友最近刚去美利坚了 没网 好气。。。
  如果去找国内的同行大牛 就要和导师说一声,毕竟都是认识的人,国内做我们这一行的就那几个。。。
  

  所以说 有没有好一点的氨基酸序列反推核算序列的方法呢?
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ken19860823

木虫 (正式写手)

用密码子优化软件优化为酵母就可以做y2h了啊,没那么麻烦

发自小木虫Android客户端
做基因修饰的老菜鸡
2楼2016-12-16 16:46:20
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_Unicorn

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ken19860823 at 2016-12-16 16:46:20
用密码子优化软件优化为酵母就可以做y2h了啊,没那么麻烦

已经搞定了 谢谢
3楼2016-12-16 23:22:49
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