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仅仅知道蛋白的氨基酸序列 如何得知cDNA核酸序列
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在MPMI上找到了一篇与自己研究课题相关的文献 , 由于那篇文章挖掘了新的effector,而且做的龄期表达,所以很想找些其中 感觉很不错的effector做做Y2H。但是要命的是文中没有给出NCBI上的序列号,所以无从下手后来又在另一篇文献里面发现国内一个 同行大牛找到了编号相同的序列,欣喜若狂,终于知道了序列被上传到了其他的数据库中,但是在那个数据库里面,只有蛋白序列, 琢磨了半天也没找到相关的核酸序列。 想用氨基酸序列反推 但是其实太难了 ,用ncbi上的BLAST 来找蛋白与转录组的blast 试了几个数据库的类似蛋白都没结果。 小老板说可以找师兄的朋友找一下,但是师兄的朋友最近刚去美利坚了 没网 好气。。。 如果去找国内的同行大牛 就要和导师说一声,毕竟都是认识的人,国内做我们这一行的就那几个。。。 所以说 有没有好一点的氨基酸序列反推核算序列的方法呢? |
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ken19860823
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