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guitar2033

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【求助】并行计算效率

各位虫友,我将两台多核的机器并行起来进行计算,结果比单机算还要慢?
请问可能是什么原因?
用的NFS。大家帮帮忙啊!
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wgpig

木虫 (小有名气)


mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢你的帮助!
1)交换机的原因
2)MPI设置
2楼2008-12-08 16:40:30
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guitar2033

至尊木虫 (职业作家)

交换机有没有什么推荐?我用的是那种最便宜的千兆交换机。
mpi大家一般使用的是那种?哪个版本啊?
多谢大家的帮忙!
3楼2008-12-08 19:31:31
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wgpig

木虫 (小有名气)


mingdong(金币+1,VIP+0):谢谢你的帮助!
交换机除了IB之外的效率都一般。
MPI取决于你所采用的软件所需要的环境。
4楼2008-12-09 09:27:42
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西


xuefei06(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎你多多关注计算综合版!
两台机器你使用什么交换机啊》
直接使用网线连接就行了!
两台机器都是用千兆网卡就行了
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
5楼2008-12-09 11:25:10
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wgpig

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by abbott at 2008-12-9 11:25:
两台机器你使用什么交换机啊》
直接使用网线连接就行了!
两台机器都是用千兆网卡就行了

直连?
给个例子看看,包括MPI效率,峰值和稳定性。
6楼2008-12-09 20:56:35
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guitar2033

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by wgpig at 2008-12-9 20:56:


直连?
给个例子看看,包括MPI效率,峰值和稳定性。

同问,不知道是否可行?
7楼2008-12-09 21:56:48
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wuhanhgf2002

金虫 (正式写手)

★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算综合版!
可能有两个原因,1,你的并行环境是否配置正确,rsh和ssh都要配成无密码登陆,如果没有做,那么多个cpu和一个cpu是一样的速度。2,你的网络问题,推荐用infinitband来做并行,或者用双千兆网卡绑定。
8楼2008-12-10 08:30:23
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guitar2033

至尊木虫 (职业作家)

谢谢ls的兄弟,看来我的应该主要是第二个问题,从应用程序的输出结果来看,我的cpu时间并不多,但是system time 占了近一半。
关于网络的优化,ls的虫友能否说的具体些呢?谢谢啊!
9楼2008-12-10 11:02:47
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西

★ ★
mingdong(金币+2,VIP+0):谢谢您的帮助!
我机器规模下,
只有两台机器
每个都有千兆的网卡接口!

直接用一个一头反接的网线,采用TCP/IP 协议,
一个是10.0.0.1
一个是10.0.0.2 mask 255.255.255.0
不需要网关!
我就这么链接的机器!

做G03并行,通过linda,
由于我其中的一个机器,是laptop,硬盘速度5400rpm的,监控到的网络传送速度峰值:45MB/s.
在做test397的时候,无太多的系统等待时间;这里是和两台采用100Mbps口的网卡直连时候的执行效率比较的!

我朋友讲,如果机器上,都有两个千兆的网络结构的话,还是采用反接网线直连,再配置网卡平航负载,效率会比采用交换机好一点!
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
10楼2008-12-12 00:07:40
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