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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 菌种资源 » 请问哪里可以查凝结芽孢杆菌的全基因组
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shi6625893

金虫 (小有名气)

[交流] 请问哪里可以查凝结芽孢杆菌的全基因组 已有2人参与

请问哪里可以查凝结芽孢杆菌的全基因组，NCBI中可以查到全基因组但我找的其中的基因感觉不全，他是不是没有全部标出来
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1楼 2016-12-13 15:33:03
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二十一业

铜虫 (小有名气)
★
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凝结芽孢杆菌Bacillus coagulans
genebank中有22个基因组测序数据，其中6个complete genome
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/?term=Bacillus%20coagulans
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2楼2016-12-15 09:39:41
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shi6625893

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 二十一业 at 2016-12-15 09:39:41
凝结芽孢杆菌Bacillus coagulans
genebank中有22个基因组测序数据，其中6个complete genome
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/?term=Bacillus%20coagulans

为什么文献上说ATCC中有3个L-乳酸脱氢酶和一个D-乳酸脱氢酶，为什么我在其全基因组中没有找到。
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3楼2016-12-15 16:51:35
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二十一业

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by shi6625893 at 2016-12-15 16:51:35
为什么文献上说ATCC中有3个L-乳酸脱氢酶和一个D-乳酸脱氢酶，为什么我在其全基因组中没有找到。...

你怎么找的？
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4楼2016-12-15 18:08:27
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shi6625893

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 二十一业 at 2016-12-15 18:08:27
你怎么找的？...

上NCBI的网站，在搜索栏选择genome然后输入Bacillus coagulans，点击所有菌株（list）选择ATCC，点击全基因，然后用Ctrl+F快捷键出现搜索栏，在搜索栏中如入乳酸脱氢酶，看有几种乳酸脱氢酶。请问是这样吗？
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5楼2016-12-16 09:16:42
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二十一业

铜虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
5楼: Originally posted by shi6625893 at 2016-12-16 09:16:42
上NCBI的网站，在搜索栏选择genome然后输入Bacillus coagulans，点击所有菌株（list）选择ATCC，点击全基因，然后用Ctrl+F快捷键出现搜索栏，在搜索栏中如入乳酸脱氢酶，看有几种乳酸脱氢酶。请问是这样吗？...

我能在Bacillus coagulans DSM 1 = ATCC 7050, complete genome（GenBank: CP009709.1）中搜到4个L-乳酸脱氢酶（L-lactate dehydrogenase）
你是没搜对关键词吧
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6楼2016-12-16 09:49:33
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匿名

用户注销 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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7楼2018-12-10 11:29:21
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