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shi6625893

金虫 (小有名气)

[交流] 请问哪里可以查凝结芽孢杆菌的全基因组 已有2人参与

请问哪里可以查凝结芽孢杆菌的全基因组,NCBI中可以查到全基因组但我找的其中的基因感觉不全,他是不是没有全部标出来
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二十一业

铜虫 (小有名气)


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凝结芽孢杆菌Bacillus coagulans
genebank中有22个基因组测序数据,其中6个complete genome
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/?term=Bacillus%20coagulans
2楼2016-12-15 09:39:41
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shi6625893

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 二十一业 at 2016-12-15 09:39:41
凝结芽孢杆菌Bacillus coagulans
genebank中有22个基因组测序数据,其中6个complete genome
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/?term=Bacillus%20coagulans

为什么文献上说ATCC中有3个L-乳酸脱氢酶和一个D-乳酸脱氢酶,为什么我在其全基因组中没有找到。
3楼2016-12-15 16:51:35
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二十一业

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by shi6625893 at 2016-12-15 16:51:35
为什么文献上说ATCC中有3个L-乳酸脱氢酶和一个D-乳酸脱氢酶,为什么我在其全基因组中没有找到。...

你怎么找的?
4楼2016-12-15 18:08:27
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shi6625893

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 二十一业 at 2016-12-15 18:08:27
你怎么找的?...

上NCBI的网站,在搜索栏选择genome然后输入Bacillus coagulans,点击所有菌株(list)选择ATCC,点击全基因,然后用Ctrl+F快捷键出现搜索栏,在搜索栏中如入乳酸脱氢酶,看有几种乳酸脱氢酶。请问是这样吗?
5楼2016-12-16 09:16:42
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二十一业

铜虫 (小有名气)


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引用回帖:
5楼: Originally posted by shi6625893 at 2016-12-16 09:16:42
上NCBI的网站,在搜索栏选择genome然后输入Bacillus coagulans,点击所有菌株(list)选择ATCC,点击全基因,然后用Ctrl+F快捷键出现搜索栏,在搜索栏中如入乳酸脱氢酶,看有几种乳酸脱氢酶。请问是这样吗?...

我能在Bacillus coagulans DSM 1 = ATCC 7050, complete genome(GenBank: CP009709.1)中搜到4个L-乳酸脱氢酶(L-lactate dehydrogenase)
你是没搜对关键词吧
6楼2016-12-16 09:49:33
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匿名

用户注销 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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7楼2018-12-10 11:29:21
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