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个人电脑安装openmpi,运行并行程序出现错误
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通过yum命令安装openmpi: yum install openmpi openmpi-devel 然后配制环境变量 export PATH=$PATH:/usr/lib64/openmpi/bin export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib64/openmpi/lib 运行abinit: mpirun -np 2 abinit<t1x.files>log & 单核运行没有问题,双核就报错了,请问是什么原因???谢谢! log文件: ------------------------------------------------------- Primary job terminated normally, but 1 process returned a non-zero exit code.. Per user-direction, the job has been aborted. ------------------------------------------------------- -------------------------------------------------------------------------- mpirun detected that one or more processes exited with non-zero status, thus causing the job to be terminated. The first process to do so was: Process name: [[56854,1],1] Exit code: 2 -------------------------------------------------------------------------- |
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送红花一朵 |
我开始不是用并行版的abinit,后改用以下命令编译: ./configure --prefix=/home/abinit FC=mpif90 --enable-mpi=yes, 编译过程报错: checking whether to enable OpenMP support... no checking whether to build MPI code... yes checking whether the C compiler supports MPI... no checking whether the C++ compiler supports MPI... no checking whether the Fortran Compiler supports MPI... no checking whether MPI is usable... no configure: error: MPI support is broken - please fix your config parameters and/or MPI installation 请问可以用yum命令安装openmpi,并编译并行版的abinit吗? http://muchong.com/html/201405/7409996.html |
4楼2016-12-12 22:46:16
souledge
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2楼2016-12-12 00:10:31
送红花一朵 |
我开始不是用并行版的abinit,后改用以下命令编译: ./configure --prefix=/home/abinit FC=mpif90 --enable-mpi=yes, 编译过程报错: checking whether to enable OpenMP support... no checking whether to build MPI code... yes checking whether the C compiler supports MPI... no checking whether the C++ compiler supports MPI... no checking whether the Fortran Compiler supports MPI... no checking whether MPI is usable... no configure: error: MPI support is broken - please fix your config parameters and/or MPI installation 请问可以用yum命令安装openmpi,并编译并行版的abinit吗? http://muchong.com/html/201405/7409996.html |
3楼2016-12-12 22:45:43
souledge
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可以是可以，但是相信解决方案比自己编译OpenMPI再编译Abinit要难得多的多，需要对编译非常熟悉的人才可能搞定～如果这个功夫有了，就可以开始考虑编译Windows版的并行程序了。 一般的思路，就是首先选定编译器，比如GNU的，还是Intel的，还是PGI的，还是PathScale的，反正不管哪个都好，选择好了之后，用该编译器编译OpenMPI并且设置环境变量。然后，用编译出的OpenMPI中的mpif90，mpicc，mpicxx等并行编译器（其实本质上还是上述编译器中选定的那一种）来编译Abinit。这也就是平时大家说的用XXX编译器做的并行编译。 |
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5楼2016-12-12 23:11:22