应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 寻找过渡态柔性扫面相关
111/2返回列表12下一页
查看: 2459  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

茶新味sweet

新虫 (小有名气)

[求助] 寻找过渡态柔性扫面相关 已有1人参与

各位大神，这是寻找过渡态的时候柔性扫面的输入部分，结果总是出现要么L103要么L301错误，怎么解决的呢。请问柔性扫面用设置初始值吗？还有用算freq，我想的是如果也算freq，是不是每个扫面的结构就对应一个freq，我们只需找freq虚频最大的就可以找到了过渡态呢。

寻找过渡态柔性扫面相关
输入部分.png


寻找过渡态柔性扫面相关-1
输出报错部分.png
回复此楼

» 猜你喜欢
追乎其上，得乎其中；追乎其中，得乎其下；追乎其下，一无所得。
1楼 2016-12-11 09:35:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

小范范1989

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 茶新味sweet at 2016-12-11 17:52:04
还是出错，这样操作是什么依据呢？
这是报错信息
Cartesian Forces:  Max     0.000398598 RMS     0.000132725
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimiz ...

你搜素一下这个Error in internal coordinate system.
我感觉你的180问题，因为现在高斯09A或者D，不能改变初始数值来扫描，从默认的初始值开始。
赞一下(1人) 回复此楼
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
4楼2016-12-11 20:28:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)
1：可以吧maxcycle=200去掉
2：把4 6 8 180中的180去掉。
赞一下 回复此楼
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
2楼2016-12-11 11:31:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

茶新味sweet

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小范范1989 at 2016-12-11 11:31:37
1：可以吧maxcycle=200去掉
2：把4 6 8 180中的180去掉。

还是出错，这样操作是什么依据呢？
这是报错信息
Cartesian Forces:  Max     0.000398598 RMS     0.000132725
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
NTrRot=    -1 NTRed=    35 NAtoms=     8 NSkip=    17 IsLin=F
Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /home/gauss/g09a02/g09/l103.exe at Sun Dec 11 18:04:34 2016.
Job cpu time:  0 days  0 hours  2 minutes 20.5 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     10 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
赞一下 回复此楼
追乎其上，得乎其中；追乎其中，得乎其下；追乎其下，一无所得。
3楼2016-12-11 17:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

茶新味sweet

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小范范1989 at 2016-12-11 20:28:00
你搜素一下这个Error in internal coordinate system.
我感觉你的180问题，因为现在高斯09A或者D，不能改变初始数值来扫描，从默认的初始值开始。...

180度有什么问题吗，就是设置了变量就开始扫面，跟开始的度数有什么关系吗
赞一下 回复此楼
追乎其上，得乎其中；追乎其中，得乎其下；追乎其下，一无所得。
5楼2016-12-11 21:47:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

极乐禅宗

新虫 (正式写手)
应该用内坐标表示分子结构

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
6楼2016-12-12 06:39:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

极乐禅宗

新虫 (正式写手)
最后的扫描A a1  a2  a3  S  18  -5

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2016-12-12 06:40:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

极乐禅宗

新虫 (正式写手)
a1  a2  a3  你要扫描的原子编号

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2016-12-12 06:41:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

极乐禅宗

新虫 (正式写手)
要看能量最高点，从最高点开始进行过渡态优化

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
9楼2016-12-12 06:42:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1、无论是柔性还是刚性扫描，都不用设置初始值，因为初始值可以根据你给定的分子说明计算出来，不需要特别说明，所以去掉180.0。另外，内坐标错误是因为高斯里键角不能人为设置为180，即你不能从180°开始扫，但是你可以反过来从90°扫到180°，对于势能面来说没有区别，亲测可以。
2、柔性扫描扫的是势能面，通过势能面可能可以找到过渡态的近似结构，和频率没有关系，也不需要算频率，而且你对频率和过渡态的理解有很大误区，建议去了解一下相关知识。
3、建议以后不要用贴图的方式贴你的输入文件，我帮你测试还要一个一个原子自己输，过于麻烦。
赞一下 回复此楼
10楼2016-12-12 09:46:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 茶新味sweet 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +3 Tide man 2026-08-14 4/200 2026-08-14 16:33 by Yeuchan
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +4 Ldrop2023 2026-08-13 4/200 2026-08-14 14:50 by Tide man
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +5 cratir 2026-08-14 9/450 2026-08-14 12:25 by 医学老男孩
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] fileCode有新解读？ +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭