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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 寻找过渡态柔性扫面相关
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茶新味sweet

新虫 (小有名气)

[求助] 寻找过渡态柔性扫面相关 已有1人参与

各位大神，这是寻找过渡态的时候柔性扫面的输入部分，结果总是出现要么L103要么L301错误，怎么解决的呢。请问柔性扫面用设置初始值吗？还有用算freq，我想的是如果也算freq，是不是每个扫面的结构就对应一个freq，我们只需找freq虚频最大的就可以找到了过渡态呢。

寻找过渡态柔性扫面相关
输入部分.png


寻找过渡态柔性扫面相关-1
输出报错部分.png
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追乎其上，得乎其中；追乎其中，得乎其下；追乎其下，一无所得。
1楼 2016-12-11 09:35:01
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

小范范1989

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 茶新味sweet at 2016-12-11 17:52:04
还是出错，这样操作是什么依据呢？
这是报错信息
Cartesian Forces:  Max     0.000398598 RMS     0.000132725
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimiz ...

你搜素一下这个Error in internal coordinate system.
我感觉你的180问题，因为现在高斯09A或者D，不能改变初始数值来扫描，从默认的初始值开始。
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
4楼2016-12-11 20:28:00
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普通回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)
1：可以吧maxcycle=200去掉
2：把4 6 8 180中的180去掉。
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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
2楼2016-12-11 11:31:37
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茶新味sweet

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小范范1989 at 2016-12-11 11:31:37
1：可以吧maxcycle=200去掉
2：把4 6 8 180中的180去掉。

还是出错，这样操作是什么依据呢？
这是报错信息
Cartesian Forces:  Max     0.000398598 RMS     0.000132725
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
NTrRot=    -1 NTRed=    35 NAtoms=     8 NSkip=    17 IsLin=F
Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /home/gauss/g09a02/g09/l103.exe at Sun Dec 11 18:04:34 2016.
Job cpu time:  0 days  0 hours  2 minutes 20.5 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     10 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
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追乎其上，得乎其中；追乎其中，得乎其下；追乎其下，一无所得。
3楼2016-12-11 17:52:04
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茶新味sweet

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小范范1989 at 2016-12-11 20:28:00
你搜素一下这个Error in internal coordinate system.
我感觉你的180问题，因为现在高斯09A或者D，不能改变初始数值来扫描，从默认的初始值开始。...

180度有什么问题吗，就是设置了变量就开始扫面，跟开始的度数有什么关系吗
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追乎其上，得乎其中；追乎其中，得乎其下；追乎其下，一无所得。
5楼2016-12-11 21:47:22
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极乐禅宗

新虫 (正式写手)
应该用内坐标表示分子结构

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6楼2016-12-12 06:39:28
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极乐禅宗

新虫 (正式写手)
最后的扫描A a1  a2  a3  S  18  -5

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7楼2016-12-12 06:40:54
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极乐禅宗

新虫 (正式写手)
a1  a2  a3  你要扫描的原子编号

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8楼2016-12-12 06:41:48
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极乐禅宗

新虫 (正式写手)
要看能量最高点，从最高点开始进行过渡态优化

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9楼2016-12-12 06:42:40
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1、无论是柔性还是刚性扫描，都不用设置初始值，因为初始值可以根据你给定的分子说明计算出来，不需要特别说明，所以去掉180.0。另外，内坐标错误是因为高斯里键角不能人为设置为180，即你不能从180°开始扫，但是你可以反过来从90°扫到180°，对于势能面来说没有区别，亲测可以。
2、柔性扫描扫的是势能面，通过势能面可能可以找到过渡态的近似结构，和频率没有关系，也不需要算频率，而且你对频率和过渡态的理解有很大误区，建议去了解一下相关知识。
3、建议以后不要用贴图的方式贴你的输入文件，我帮你测试还要一个一个原子自己输，过于麻烦。
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10楼2016-12-12 09:46:23
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