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Ivy尘

新虫 (正式写手)

[交流] PCR产物酶切连接pET 28a,测序发现引物部分碱基缺一个C

最近实验一直不顺利,各种突变和缺失,累觉不爱。

上游引物加了保护碱基和Ndel/Xbal酶切位点,引物开头是5’-tctagaCATATGGCCAG.........

测序回来,峰图很干净,完全没有套峰。
PCR产物酶切连接pET 28a,测序发现引物部分碱基缺一个C
突变的碱基就不管了,但是开头CATATGGCAG, 少了个C!!!后面都乱码了,跪。。。。。
PCR产物酶切连接pET 28a,测序发现引物部分碱基缺一个C-1

问了生工测序,也回答说测序没问题。

我觉得也不该是KOD酶的问题吧,毕竟在引物上呢,也能突变缺失吗?会不会是引物本身少了C导致的,虽然检测报告写的正常。
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781055707

木虫 (著名写手)

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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-07 06:25:05
Ivy尘: 金币+1 2016-12-07 09:37:04
做的实验多了,难免碰上坑。
采菊东篱下,悠然见南山。
4楼2016-12-06 16:39:26
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Ivy尘

新虫 (正式写手)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-07 06:24:47

泪流满面
2楼2016-12-06 14:21:46
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Ivy尘

新虫 (正式写手)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-07 06:24:53
生工说要重新给我合成引物,妈蛋,要是是引物问题,我就要气死了
3楼2016-12-06 15:04:19
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Ivy尘

新虫 (正式写手)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-07 06:25:32
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4楼: Originally posted by 781055707 at 2016-12-06 16:39:26
做的实验多了,难免碰上坑。

最近光掉坑了……

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5楼2016-12-06 18:27:53
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sky蒲公英

版主 (文坛精英)

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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-07 06:25:43
我的测序开头多了个碱基c

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知识就像蒲公英的花儿一样,播种在世界的每一个角落。
6楼2016-12-06 18:37:40
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Ivy尘

新虫 (正式写手)


xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-07 06:25:49
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6楼: Originally posted by sky蒲公英 at 2016-12-06 18:37:40
我的测序开头多了个碱基c

载体上的吗?

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7楼2016-12-06 22:27:01
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sky蒲公英

版主 (文坛精英)

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引用回帖:
7楼: Originally posted by Ivy尘 at 2016-12-06 22:27:01
载体上的吗?
...

不是,我的是插入片段。在测序结果刚开始的10bp里多。

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知识就像蒲公英的花儿一样,播种在世界的每一个角落。
8楼2016-12-06 22:30:14
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sky蒲公英

版主 (文坛精英)

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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-07 06:26:44
引用回帖:
8楼: Originally posted by sky蒲公英 at 2016-12-06 22:30:14
不是,我的是插入片段。在测序结果刚开始的10bp里多。
...

是菌液测序的。只测了插入片段

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9楼2016-12-06 22:31:11
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kungfu2016

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Ivy尘: 金币+1 2016-12-07 09:37:15
引物本身有问题吧

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10楼2016-12-06 23:01:31
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