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专整pbm

新虫 (初入文坛)

[交流] MS建立的硫酸根模型是否正确，pdb文件如下，求指教

怎么改变氧离子的电荷量，怎么构建正确的离子模型，下面是利用MS软件导出的pdb文件：
REMARK   Materials Studio PDB file
REMARK   Created:  Mon Dec 05 01:36:38 中国标准时间 2016
ATOM      1  S   MOL     1      -1.124   0.362   0.823  1.00  0.00           S   
ATOM      2  O   MOL     1       0.032   1.269  -0.383  1.00  0.00           O1-  
ATOM      3  O   MOL     1      -0.104  -0.807   1.920  1.00  0.00           O1-  
ATOM      4  O   MOL     1      -2.403  -0.644  -0.159  1.00  0.00           O1-  
ATOM      5  O   MOL     1      -2.021   1.631   1.917  1.00  0.00            O1-  
TER       6
CONECT    1    2    3    4    5
CONECT    2    1
CONECT    3    1
CONECT    4    1
CONECT    5    1
END
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1楼 2016-12-05 18:59:44
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