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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 老师让找几个序列，设计引物，在cDNA上扩增，但是这个序列是什么序列啊
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丹壹辉

新虫 (小有名气)

[交流] 老师让找几个序列，设计引物，在cDNA上扩增，但是这个序列是什么序列啊

老师让找几个序列，设计引物，在cDNA上扩增，但是这个序列是什么序列啊？是氨基酸序列，还是核酸序列啊？我找的是核酸序列，到比对过之后，再去找设计引物的资料，大家都说比对的时候用氨基酸序列。所以我懵了，跟我的认知不一样。

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1楼 2016-12-03 23:52:43
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意萧02

木虫 (正式写手)
★ ★
丹壹辉(金币+1): 谢谢参与
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-04 05:11:51
氨基酸序列不就是cDNA序列上CDS编码的嘛，你把概念和怎么来的读懂一下就理解咯

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赵一霏
5楼2016-12-04 00:48:03
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sky蒲公英

版主 (文坛精英)
★ ★
丹壹辉(金币+1): 谢谢参与
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-04 05:11:43
核酸序列，cds区

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3楼2016-12-04 00:27:41
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wsywxs

木虫 (正式写手)
★ ★
丹壹辉(金币+1): 谢谢参与
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-04 05:11:59
氨基酸序列就是cDNA转录翻译过来，没区别啊

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6楼2016-12-04 01:01:01
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月夜鸣鸣

铜虫 (初入文坛)
★ ★
丹壹辉(金币+1): 谢谢参与
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-12-04 05:12:06
设计引物时当然要用核酸序列，需要注意的是mRNA中的CDS区，blast的时候可以是核酸也可以是氨基酸序列，有些核酸的改变并未导致氨基酸的变异

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8楼2016-12-04 01:15:43
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丹壹辉

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by sky蒲公英 at 2016-12-04 00:27:41
核酸序列，cds区

谢谢

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12楼2016-12-04 23:42:35
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丹壹辉

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 月夜鸣鸣 at 2016-12-04 01:15:43
设计引物时当然要用核酸序列，需要注意的是mRNA中的CDS区，blast的时候可以是核酸也可以是氨基酸序列，有些核酸的改变并未导致氨基酸的变异

嗯嗯，谢谢，好像明白了一点点

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13楼2016-12-04 23:43:39
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丹壹辉

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 意萧02 at 2016-12-04 00:48:03
氨基酸序列不就是cDNA序列上CDS编码的嘛，你把概念和怎么来的读懂一下就理解咯

嗯嗯，核酸序列是测序来的，那氨基酸序列是直接从核酸序列通过机器翻译来的吗？  通过比对，设计兼并引物，核酸比对结果跟氨基酸比对结果不一样的，你觉的采用哪个比较好？非常感谢！

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14楼2016-12-04 23:53:59
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意萧02

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
14楼: Originally posted by 丹壹辉 at 2016-12-04 23:53:59
嗯嗯，核酸序列是测序来的，那氨基酸序列是直接从核酸序列通过机器翻译来的吗？  通过比对，设计兼并引物，核酸比对结果跟氨基酸比对结果不一样的，你觉的采用哪个比较好？非常感谢！
...

氨基酸与核酸比对结果没有可比性，看你设计的引物干嘛用了

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15楼2016-12-05 00:41:48
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赵一霏

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 意萧02 at 2016-12-04 00:48:03
氨基酸序列不就是cDNA序列上CDS编码的嘛，你把概念和怎么来的读懂一下就理解咯

你好可以问一下cds区是什么意思吗？可以说的详细一些吗？

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16楼2016-12-06 14:42:54
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意萧02

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
16楼: Originally posted by 赵一霏 at 2016-12-06 14:42:54
你好可以问一下cds区是什么意思吗？可以说的详细一些吗？
...

用英文来讲你就明白了，CDS也就是 coding sequence. 指的就是基因的编码区序列，一个基因有编码区，有非编码区，也可以简单的认为就是外显子区和内涵子区，在复制的过程中，内涵子区没有编码蛋白，但是现在研究认为内涵子在转录过程中可能有起到一定的作用，具体未知。CDS区简单的理解就是有编码蛋白功能的区域，转录后行使一定的功能。

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17楼2016-12-06 20:41:39
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意萧02

木虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 意萧02 at 2016-12-06 20:41:39
用英文来讲你就明白了，CDS也就是 coding sequence. 指的就是基因的编码区序列，一个基因有编码区，有非编码区，也可以简单的认为就是外显子区和内涵子区，在复制的过程中，内涵子区没有编码蛋白，但是现在研究认为 ...

是内含子，打错字了

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18楼2016-12-06 20:42:44
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Feynmanux2楼
2016-12-04 00:06   回复  
丹壹辉(金币+1): 谢谢参与
tan9144楼
2016-12-04 00:33   回复  
丹壹辉(金币+1): 谢谢参与
syhorchid7楼
2016-12-04 01:11   回复  
丹壹辉(金币+1): 谢谢参与
xhmaohan9楼
2016-12-04 02:20   回复  
丹壹辉(金币+1): 谢谢参与
youngen10楼
2016-12-04 06:14   回复  
丹壹辉(金币+1): 谢谢参与
tzynew11楼
2016-12-04 06:44   回复  
丹壹辉(金币+1): 谢谢参与
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