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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 蛋白相互作用分析中，如何将STRING中得到的相互作用数据导入到cytospace软件中作图？
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百目充

铁虫 (小有名气)

[求助] 蛋白相互作用分析中，如何将STRING中得到的相互作用数据导入到cytospace软件中作图？ 已有1人参与

大家好，请问蛋白质组鉴定到的蛋白数据在STRING中获得相互作用关系后，怎么才能将这些相互作用在cytospace软件中作图？或者怎样直接将鉴定到的蛋白质在cytospace中进行相互作用分析？
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百目充

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未来不是梦。。。
1楼 2016-12-02 20:05:45
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠

【答案】应助回帖

string里是支持下载互作关系对的，tsv格式，可以用excel或者txt软件打开。
cytoscape软件导入是在 fiel——import——network——file里就可以了。
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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭
2楼2016-12-06 13:56:03
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普通回帖

百目充

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
谢谢，学习了，已解决问题。
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未来不是梦。。。
3楼2016-12-06 14:39:20
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木子爱赤子

新虫 (初入文坛)
请问string里面哪里显示基因的degree啊

发自小木虫Android客户端
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4楼2017-02-10 09:30:49
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Hey Daring

新虫 (正式写手)
楼楼 我最近也在做这个软件 头要炸了 有没有说明书方便给我下么 拜托拜托了
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5楼2017-02-28 21:10:15
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刘成功

木虫 (著名写手)
不造

发自小木虫IOS客户端
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我辈只是蓬蒿人……
6楼2017-02-28 21:33:52
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百目充

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Hey Daring at 2017-02-28 21:10:15
楼楼 我最近也在做这个软件 头要炸了 有没有说明书方便给我下么 拜托拜托了

没有这个软件的说明书，只有一个培训班的相关文件，发给你看一下吧。
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  • 附件 1 : cytoscape_&_IGV_应用.pdf
    • 2017-03-01 14:57:08, 2.62 M
未来不是梦。。。
7楼2017-03-01 14:57:12
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Hey Daring

新虫 (正式写手)
内容已删除
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8楼2017-03-01 14:59:25
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Hey Daring

新虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 百目充 at 2017-03-01 14:57:12
没有这个软件的说明书，只有一个培训班的相关文件，发给你看一下吧。...

额 看到了 不好意思啊 嘿嘿 谢谢
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9楼2017-03-01 14:59:54
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Hey Daring

新虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 百目充 at 2017-03-01 14:57:12
没有这个软件的说明书，只有一个培训班的相关文件，发给你看一下吧。...

大神 我下载的三个版本的cytoscape 2.6 3.2 3.4的 但是Java下载的8.0的 可是只能打开旧版本2.6 能不能麻烦发我个匹配的Java和cytoscape呢
赞一下 回复此楼
10楼2017-03-01 16:56:13
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