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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求回答！~为什么高通量测序要把DNA打成小片段？
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JZ9630

新虫 (初入文坛)

[求助] 求回答！~为什么高通量测序要把DNA打成小片段？

高通量测序要把DNA打成200bp左右的小片段，比如illumina和solexa，也就是我想问为什么这些测序仪器只能读取200bp左右的长度？是准确率的缘故还是其他原因？~谢谢大家啦
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1楼 2016-12-01 22:47:16
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太阳的电子

新虫 (小有名气)
当序列大于200bp时测序结果可信度大幅度下降结果不可靠，所以只测200bp以内的～

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2楼2016-12-01 23:10:18
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JZ9630

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 太阳的电子 at 2016-12-01 23:10:18
当序列大于200bp时测序结果可信度大幅度下降结果不可靠，所以只测200bp以内的～

恩~那可信度下降的原因呢？是仪器的限制吗？

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3楼2016-12-02 08:02:44
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602059625

金虫 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by JZ9630 at 2016-12-02 08:02:44
恩~那可信度下降的原因呢？是仪器的限制吗？
...

Cluster里不同的DNA strand延伸可能不同步，比如加C的有的链加上了，有的链可能没加上
越到后面不同步的越多

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4楼2016-12-02 09:44:06
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602059625

金虫 (知名作家)
太长的片段也不容易在flow cell上形成cluster

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JZ9630
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5楼2016-12-02 09:47:03
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JZ9630

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 602059625 at 2016-12-02 09:47:03
太长的片段也不容易在flow cell上形成cluster

明白了，感谢^ω^

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6楼2016-12-02 16:27:20
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