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甲基化特异性PCR 已有1人参与
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DNA甲基化是一种表观遗传修饰,它是由DNA甲基转移酶(DNA methyl-transferase, Dnmt)催化S-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,将胞嘧啶转变为5-甲基胞嘧啶(mC)的一种反应,在真核生物DNA中,5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化学性修饰碱基。 实验方法原理 MSP是一种简便、特异的、敏感的检测单基因甲基化的方式。其基本原理是用亚硫酸氢钠处理基因组DNA,未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变,然后用3对特异性的引物对所测基因的同一核苷酸序列进行扩增。扩增产物用DNA琼脂糖凝胶电泳,凝胶扫描观察分析结果。 实验材料 DAN 试剂、试剂盒:亚硫酸氢钠、氢醌、石蜡油、乙醇 仪器、耗材:水浴锅、PCR仪 实验步骤 1. 在50 μl 体系中,DNA(2~5 μg)经NaOH(终浓度值0.2 mol/L)在37℃变性10 Min。 2. 对于ng级别的人基因组DNA,在进行修饰前加入2μg蛙鱼精DNA为载体。 3. 加入30 μl 刚配制好的10 mmo/L 氢醌与520/1的40.5%亚硫酸氢钠混匀。 4. 然后用石蜡油隔绝空气的条件下,避光在50%温育16 h。 5. 修饰后的DNA过WizerdDNA纯化柱,用50/1 L 水洗脱。 6. 室温下用NaOH(终浓度为0.3 mol/L)修饰5 min,之后用乙醇沉淀。 7. DNA溶于20 μl 水中,立即使用或在-20℃保存。 |
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