24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
查看: 1164  |  回复: 0

hp以火之名

银虫 (小有名气)

[求助] 【求助】Gaussian错误求助:One-electron integrals ...Zero scale factor in PutShl

请教我的这个哪里出现了问题?
描述:用oniom计算AT碱基对与镉离子,分三层。
错误信息:One-electron integrals computed using PRISM.
Zero scale factor in PutShl.
Error termination via Lnk1e in /vol-th/home/bosong/g09/l302.exe
输入文件:
%nprocshared=20
%mem=8GB
#p opt oniom(mp2/genecp:pm3:uff) geom=connectivity

ATP-Cd-oniom3

1 1 0 2 0 2 1 1 1 1 1 1
O-O_2            0   -1.04166671    0.06578947    0.00000000 M
P-P_3+q-1.165900  0   -0.89066671    1.65378947   -0.11900000 M
O-O_2--0.776100  0   -0.65166671    2.23178947    1.22200000 M
O-O_2--0.776100  0   -2.04566671    2.20778947   -0.86100000 M
O-O_2--0.495400  0    0.43533329    1.78078947   -1.00500000 M
C-C_3--0.006900  0    1.52533329    0.87078947   -0.76600000 M
H-H_-0.075400    0    1.54033329    0.59178947    0.28800000 M
H-H_-0.075400    0    1.38833329   -0.01921053   -1.37900000 M
C-C_3-0.162900   0    2.84433329    1.53078947   -1.13400000 M
H-H_-0.117600    0    3.66233329    1.00978947   -0.63800000 M
O-O_3--0.369100  0    3.09133329    1.32878947   -2.55800000 M
C-C_3-0.043100   0    2.86133329    2.53778947   -3.26800000 M
H-H_-0.183800    0    3.77733329    2.84178947   -3.77500000 M
C-C_3-0.071300   0    2.90333329    3.04878947   -0.94800000 M
H-H_-0.098500    0    2.37233329    3.31078947   -0.03300000 M
C-C_3--0.085400  0    2.34133329    3.57378947   -2.27100000 M
H-H_-0.071800    0    1.45033329    4.17078947   -2.07600000 M
H-H_-0.071800    0    3.09133329    4.19178947   -2.76500000 M
O-O_3--0.654900  0    4.19333329    3.61678947   -0.77900000 M
N-N_R--0.026800  0    1.90433329    2.27778947   -4.42000000 M
C-C_R-0.160700   0    0.53533329    2.23778947   -4.46400000 M
H-H_-0.187700    0   -0.03966671    2.41178947   -3.56600000 M
N-N_R--0.617500  0    0.05133329    2.04378947   -5.65500000 M
C-C_R-0.072500   0    1.18333329    1.90078947   -6.45800000 M
C-C_R-0.689700   0    1.34533329    1.67178947   -7.82900000 M
N-N_R--0.912300  0    0.32133329    1.53778947   -8.68300000 M
H-H_-0.416700    0   -0.62866671    1.60178947   -8.34600000 M
H-H_-0.416700    0    0.49933329    1.37378947   -9.66300000 M
N-N_R--0.762400  0    2.59833329    1.58378947   -8.29700000 M
C-C_R-0.571600   0    3.61033329    1.71778947   -7.44500000 M
H-H_-0.059800    0    4.62833329    1.65078947   -7.80100000 M
N-N_R--0.741700  0    3.58033329    1.95678947   -6.14500000 M
C-C_R-0.380000   0    2.30833329    2.02078947   -5.69800000 M
O-O_3            0    4.77333329    1.30378947  -16.72900000 L
C-C_3            0    5.72933329    2.31878947  -16.36900000 L
H-H_             0    6.25633329    2.65478947  -17.26200000 L
H-H_             0    5.20333329    3.15978947  -15.91600000 L
C-C_3            0    6.72933329    1.76078947  -15.37000000 L
H-H_             0    7.62733329    2.37878947  -15.37000000 L
O-O_3            0    6.18333329    1.90878947  -14.02400000 L
C-C_3            0    5.74733329    0.64878947  -13.53500000 L H-H_ 43
H-H_             0    6.35633329    0.36078947  -12.67800000 L
N-N_R            0    4.30233329    0.76078947  -13.04400000 M
C-C_R            0    3.22033329    0.64678947  -13.87600000 M
H-H_             0    3.36633329    0.46878947  -14.93100000 M
C-C_R            0    1.96933329    0.69778947  -13.39900000 M
C-C_3            0    0.77733329    0.57378947  -14.30100000 M
H-H_             0    0.80633329   -0.38821053  -14.81300000 M
H-H_             0   -0.13566671    0.64178947  -13.71000000 M
H-H_             0    0.79333329    1.37678947  -15.03800000 M
C-C_R            0    1.72433329    0.87578947  -11.99100000 M
O-O_R            0    0.61433329    0.93478947  -11.46400000 M
N-N_R            0    2.91533329    1.10678947  -11.14000000 M
H-H_             0    2.73733329    1.24178947  -10.07300000 M
C-C_R            0    4.17033329    0.98678947  -11.69900000 M
O-O_R            0    5.18433329    1.16578947  -11.04400000 M
C-C_3            0    7.03333329    0.26678947  -15.49600000 L H-H_ 62
H-H_             0    7.08133329    0.00778947  -16.55400000 L
C-C_3            0    5.92733329   -0.37621053  -14.65600000 L
H-H_             0    5.33333329   -1.03921053  -15.28400000 L
H-H_             0    6.37433329   -0.94921053  -13.84400000 L
O-O_2            0    8.27633329   -0.17421053  -14.97100000 H
P-P_3+q          0    8.71333329   -0.89221053  -14.54800000 H
O-O_2            0   10.12333329   -1.20521053  -14.86900000 H
O-O_2            0    7.69433329   -1.70721053  -15.24500000 H
O-O_2            0    8.48933329   -0.99021053  -12.96600000 H
C-C_3            0    8.95933329    0.08178947  -12.12700000 L H-H_ 66
H-H_             0    9.84633329    0.53078947  -12.57400000 L
H-H_             0    8.17533329    0.83278947  -12.03400000 L
C-C_3            0    9.30333329   -0.45321053  -10.74600000 L
H-H_             0    9.97133329    0.24478947  -10.24200000 L
O-O_3            0    8.09433329   -0.45821053   -9.92800000 L
C-C_3            0    7.61533329   -1.78621053   -9.77600000 L
H-H_             0    7.66818164   -2.07505940   -8.74708145 L
C-C_3            0    9.80233329   -1.89821053  -10.69700000 L
H-H_             0   10.45533329   -2.07321053  -11.55200000 L
C-C_3            0    8.50433329   -2.70321053  -10.61800000 L
H-H_             0    8.43733329   -3.37121053  -11.47700000 L
H-H_             0    8.49533329   -3.29121053   -9.70000000 L
O-O_3            0   10.59333329   -2.25821053   -9.57400000 L
H-H_             0    6.60350467   -1.84800405  -10.11846812 L
H-H_             0   11.52325565   -2.18542835   -9.80103997 L
H-H_             0    5.23777736    0.51194690  -17.00985057 L
H-H_-0.439600    0    4.86194642    2.95651530   -0.97545482 M
C-C_3            0   -1.95335696   -0.61218570   -0.86837236 M
H-H_             0   -1.74655010   -1.66190147   -0.85328142 M
H-H_             0   -2.95608543   -0.44140234   -0.53630513 M
H-H_             0   -1.83960885   -0.24054917   -1.86529145 M
H-H_             0    0.29323197    2.29892314    1.37775476 M
Cd-              0    9.35534206   -1.98927982  -16.94749806 H

1 2 1.5 85 1.0
2 3 2.0 4 2.0 5 1.5
3 89 1.0
4
5 6 1.0
6 7 1.0 8 1.0 9 1.0
7
8
9 14 1.0 10 1.0 11 1.0
10
11 12 1.0
12 20 1.0 16 1.0 13 1.0
13
14 15 1.0 16 1.0 19 1.0
15
16 17 1.0 18 1.0
17
18
19 84 1.0
20 21 1.5 33 1.5
21 23 2.0 22 1.0
22
23 24 1.0
24 25 1.5 33 2.0
25 26 1.5 29 1.5
26 27 1.0 28 1.0
27
28
29 30 1.5
30 31 1.0 32 2.0
31
32 33 1.5
33
34 35 1.0 83 1.0
35 36 1.0 37 1.0 38 1.0
36
37
38 39 1.0 40 1.0 57 1.0
39
40 41 1.0
41 42 1.0 43 1.0 59 1.0
42
43 44 1.5 55 1.5
44 46 2.0 45 1.0
45
46 47 1.0 51 1.5
47 48 1.0 49 1.0 50 1.0
48
49
50
51 52 2.0 53 1.0
52
53 55 1.5
54
55 56 2.0
56
57 58 1.0 59 1.0 62 1.0
58
59 60 1.0 61 1.0
60
61
62 63 2.0
63 65 2.0 66 1.5 64 2.0
64
65
66 67 1.0
67 69 1.0 68 1.0 70 1.0
68
69
70 72 1.0 75 1.0 71 1.0
71
72 73 1.0
73 77 1.0 74 1.0 81 1.0
74
75 77 1.0 76 1.0 80 1.0
76
77 78 1.0 79 1.0
78
79
80 82 1.0
81
82
83
84
85 86 1.0 87 1.0 88 1.0
86
87
88
89
90

  P O  0
6-31+g(d,p)
****
Cd 0
LANL2dz
****

Cd 0
LANL2dz


部分输出文件:
Warning!  P  atom    2 may be hypervalent but has no d functions.
Warning!  P  atom   63 may be hypervalent but has no d functions.



IExCor=    0 DFT=F Ex=HF Corr=None ExCW=0 ScaHFX=  1.000000
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000 ScalE2=  1.000000  1.000000
IRadAn=      0 IRanWt=     -1 IRanGd=            0 ICorTp=0
Leave Link  301 at Sun Nov 27 13:32:38 2016, MaxMem= 1073741824 cpu:       7.1
(Enter /vol-th/home/bosong/g09/l302.exe)
Do NDO integrals.
NPDir=0 NMtPBC=     1 NCelOv=     1 NCel=       1 NClECP=     1 NCelD=      1
         NCelK=      1 NCelE2=     1 NClLst=     1 CellRange=     0.0.
One-electron integrals computed using PRISM.
Zero scale factor in PutShl.
Error termination via Lnk1e in /vol-th/home/bosong/g09/l302.exe at Sun Nov 27 13:32:40 2016.
Job cpu time:  0 days  0 hours  1 minutes 15.7 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     10 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hp以火之名 的主题更新
信息提示
请填处理意见