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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 【求助】用MS模拟H2S吸附在MoS2晶体上，并计算吸附能
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samwood

金虫 (小有名气)

[求助] 【求助】用MS模拟H2S吸附在MoS2晶体上，并计算吸附能 已有1人参与

我是这么做的，
1，导入MoS2晶体的结果，Castep优化，并劈开表面，构建（0 0 -3）切面，并再次优化
2，将H2S摆在MoS2晶体的旁边，然后优化
每次第二步优化完以后，H2S都在晶体内部，我想问下大家，是不是有点想当然了，麻烦大伙了

【求助】用MS模拟H2S吸附在MoS2晶体上，并计算吸附能
sp161127_134350.png


【求助】用MS模拟H2S吸附在MoS2晶体上，并计算吸附能-1
sp161127_134506.png
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1楼 2016-11-27 14:22:58
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samwood

金虫 (小有名气)
自己顶一下
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2楼2016-11-28 09:00:26
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Ronny_chou

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你是想知道H2S吸附在MoS2晶体哪个位置吧，你应该选择adsorption locator来确定能量最低吸附位点
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samwood
3楼2016-11-30 22:46:01
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samwood

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by Ronny_chou at 2016-11-30 22:46:01
你是想知道H2S吸附在MoS2晶体哪个位置吧，你应该选择adsorption locator来确定能量最低吸附位点

嗯,我是打算研究含硫(氮)化合物在MoS2晶体表面的吸附情况，主要是不同吸附形式下(如平行吸附，垂直吸附什么的)，分子和MoS2晶体体系能量随吸附距离变化的趋势。唉，导师动动嘴，下面跑断腿。反正我也不知道我算的对不对，MoS2晶体是用Castep模块进行优化，然而H2S用的是Dmol 3 进行优化，然后把这两货放在一起，再用Castep进行优化。
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4楼2016-12-01 14:00:25
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lifan1233

金虫 (正式写手)
楼主，你把H2S放在MOS2旁边，是直接画上去的么？我看好多文献里面，他们是粘贴上去的。不知道跟你这有没有区别，可以粘贴到指定的地方

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越来越喜欢一个人好好学习的感觉
5楼2016-12-15 23:47:06
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samwood

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lifan1233 at 2016-12-15 23:47:06
楼主，你把H2S放在MOS2旁边，是直接画上去的么？我看好多文献里面，他们是粘贴上去的。不知道跟你这有没有区别，可以粘贴到指定的地方

我这个就是粘贴上去的，只不过我不知道我的算法对不对，好忧桑

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6楼2016-12-16 08:13:28
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lifan1233

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by samwood at 2016-12-16 08:13:28
我这个就是粘贴上去的，只不过我不知道我的算法对不对，好忧桑
...

算法应该是没问题的。另外，请教一下，你那个粘贴时怎么弄得哦，就是在另外一个文档里面画好，然后复制-粘贴过来吗？还是直接在当前的页面上画好，移动过来？求指教
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越来越喜欢一个人好好学习的感觉
7楼2016-12-16 11:04:03
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Miss_Ting

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Ronny_chou at 2016-11-30 22:46:01
你是想知道H2S吸附在MoS2晶体哪个位置吧，你应该选择adsorption locator来确定能量最低吸附位点

adsortpion locater该怎么看呢？多谢大神指导！

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8楼2016-12-16 21:43:31
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samwood

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by lifan1233 at 2016-12-16 11:04:03
算法应该是没问题的。另外，请教一下，你那个粘贴时怎么弄得哦，就是在另外一个文档里面画好，然后复制-粘贴过来吗？还是直接在当前的页面上画好，移动过来？求指教...

在其他文件画好后并优化，然后再粘贴过去

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9楼2016-12-16 22:59:43
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