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shenhaiyouyu870

[交流] PCR效果不错,为什么DGGE就是做不出来

我的样品是餐厨垃圾的堆肥样,DNA粗提,纯化和PCR效果都不错。但是DGGE就是没有条带出现,或者只有极少量弱的条带。实验做到最后阶段,出了这个问题,急死人了!各位虫虫有没有遇见类似的问题,帮忙解决一些。小妹拜谢了!

[ Last edited by amisking on 2009-8-8 at 11:18 ]
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hharl

铜虫 (初入文坛)

★ ★
amisking(金币+0,VIP+0):欢迎发帖交流! 8-8 11:18
amisking(金币+2,VIP+0): 8-8 11:19
你的pcr 产物是否存放了很长一段时间,才跑的DGGE ,
还有下回再做的时候找一个  很好的阳性对照
就知道什么问题了?
5楼2008-12-14 11:51:39
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cynjau

金虫 (小有名气)

★ ★
amisking(金币+2,VIP+0):欢迎发帖交流! 8-8 11:18
我以后要做的和你的方法差不多
建议你的DNA提取用BIO的试剂盒,5000多元,50次
PCR和DGGE效果都很好的
还有就是,你的样品多样性是不是本身就不是很丰富呢?
2楼2008-12-07 17:05:53
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maomao1426

木虫 (著名写手)

把DGGE的试剂都换一遍试试。
3楼2008-12-09 09:20:27
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sxxuan

金虫 (著名写手)

★ ★
amisking(金币+2,VIP+0):欢迎发帖交流! 8-8 11:18
如果样品的多样性本来就少的话,条带少也是正常的,不过感觉堆肥的话多样性应该比较多才对。
如楼上所讲的把试剂重新配制,包括电泳缓冲液
你的日子如何,你的力量也必如何!
4楼2008-12-09 10:47:45
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