| 查看: 826 | 回复: 4 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】如何用GaussianView打开UNIX Gaussian产生的.chk文件
|
|||
|
我的Gaussian是UNIX版本的，做完计算后，需要.chk文件来画HOMO和LUMO。 但是我发现GaussianView不能打开UNIX Gaussian产生的.chk文件，出现以下提示： CConnectionGFCHK::Initialize() Cannot find file 请问我该怎么办？ [ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 19:02 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
求助火焰封管的时候管子炸了
已经有1人回复
-
请问四氢呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀时，如何使沉淀过程加速？
已经有2人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有229人回复
-
七嗪类物质合成求助
已经有0人回复
-
Chemical Bonding at Surfaces and Interfaces,最经典的一本表面上化学相互作用教材
已经有0人回复
-
诚邀有志之士加入江苏大学环境学院合成生物学课题组！(长期接收学硕专硕、硕博连读)
已经有16人回复
-
一志愿南大理论与计算化学方向（070300）342分，求调剂
已经有1人回复
-
欢迎化学、化工、物理、材料、或计算机背景的考研咨询
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有7人回复
-
河南理工大学化工学院招收调剂生啦！
已经有1人回复
2楼2008-12-04 13:28:22
|
但是会出现下列错误 Read checkpoint file 4thNanocluster_670.chk Write formatted file 4thNanocluster_670.fchk Out-of-memory error in routine FChkPn-MO (IEnd= 7227361 MxCore= 6291456) Use %mem=7MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step. Error termination via Lnk1e at Thu Dec 4 13:20:06 2008. Segmentation fault 从这个错误消息，显然是由于内存不够，但是，我应该怎么去修改内存设置呢？formchk命令没有带修改内存大小的选项。 |
3楼2008-12-04 15:15:59
★
yyx19840628(金币+1,VIP+0):自行解决，不错啊。谢谢交流
yyx19840628(金币+1,VIP+0):自行解决，不错啊。谢谢交流
|
上面的问题已经被我解决了。 这里，我用IBM LoadLeveler提交工作。将Gaussian程序屏蔽，之后利用setenv GAUSS_MEMDEF 40000000命令，设置需要的内存。在这里例子中，我设置了4GB的内存。在formchk命令行中，不需要再次指定输出文件，而是在#@ output命令行中设置。 转换成fchk文件后，为了保险起见，我还需要用cubegen命令讲.fchk文件转换成.cube文件。显然，这回原理都是一样的。 #!/usr/bin/tcsh #@ job_type=serial #@ error = 4fchk.log #@ wall_clock_limit = 72:00:00 #@ output = 4.fchk #@ restart=no #@ queue #set path = ( $path /apps/cc/g03 ) #setenv GAUSS_EXEDIR /apps/cc/g03 #setenv g03root /apps/cc #source $g03root/g03/bsd/g03.login #setenv MP_SHARED_MEMORY yes setenv GAUSS_MEMDEF 40000000 formchk 4.chk |
4楼2008-12-04 15:53:39
spkeey
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1244.9
- 散金: 3
- 帖子: 308
- 在线: 14小时
- 虫号: 320174
- 注册: 2007-03-10
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2008-12-04 19:50:25
