| 查看: 1133 | 回复: 4 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
[交流]
【求助】如何用GaussianView打开UNIX Gaussian产生的.chk文件
|
|||
|
我的Gaussian是UNIX版本的，做完计算后，需要.chk文件来画HOMO和LUMO。 但是我发现GaussianView不能打开UNIX Gaussian产生的.chk文件，出现以下提示： CConnectionGFCHK::Initialize() Cannot find file 请问我该怎么办？ [ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 19:02 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
【2027级博士申请】双非硕・一作 SCI 3 篇（2篇CEJ 一区 Top）储能方向
已经有15人回复
-
石墨电催化体系反应动力学：污染物浓度与反应速率的关联规律
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有219人回复
-
海南大学杨金霖老师招收2027级博士生（储能电池方向）
已经有6人回复
-
highscore plus3.0报错
已经有0人回复
-
氮掺杂石墨阴极制备：掺杂量对氧还原活性的调控规律
已经有0人回复
-
电催化CO2还原
已经有1人回复
-
铁基负载石墨催化极板：金属活性位点的催化增效机制
已经有0人回复
-
石墨电催化系统参数匹配原则：水质、电流与极距的协同设计
已经有0人回复
-
锂金属电池求助
已经有1人回复
-
石墨阴极电催化耦合臭氧：协同增效还是资源浪费？
已经有0人回复
2楼2008-12-04 13:28:22
|
但是会出现下列错误 Read checkpoint file 4thNanocluster_670.chk Write formatted file 4thNanocluster_670.fchk Out-of-memory error in routine FChkPn-MO (IEnd= 7227361 MxCore= 6291456) Use %mem=7MW to provide the minimum amount of memory required to complete this step. Error termination via Lnk1e at Thu Dec 4 13:20:06 2008. Segmentation fault 从这个错误消息，显然是由于内存不够，但是，我应该怎么去修改内存设置呢？formchk命令没有带修改内存大小的选项。 |
3楼2008-12-04 15:15:59
★
yyx19840628(金币+1,VIP+0):自行解决，不错啊。谢谢交流
yyx19840628(金币+1,VIP+0):自行解决，不错啊。谢谢交流
|
上面的问题已经被我解决了。 这里，我用IBM LoadLeveler提交工作。将Gaussian程序屏蔽，之后利用setenv GAUSS_MEMDEF 40000000命令，设置需要的内存。在这里例子中，我设置了4GB的内存。在formchk命令行中，不需要再次指定输出文件，而是在#@ output命令行中设置。 转换成fchk文件后，为了保险起见，我还需要用cubegen命令讲.fchk文件转换成.cube文件。显然，这回原理都是一样的。 #!/usr/bin/tcsh #@ job_type=serial #@ error = 4fchk.log #@ wall_clock_limit = 72:00:00 #@ output = 4.fchk #@ restart=no #@ queue #set path = ( $path /apps/cc/g03 ) #setenv GAUSS_EXEDIR /apps/cc/g03 #setenv g03root /apps/cc #source $g03root/g03/bsd/g03.login #setenv MP_SHARED_MEMORY yes setenv GAUSS_MEMDEF 40000000 formchk 4.chk |
4楼2008-12-04 15:53:39
spkeey
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1244.9
- 散金: 3
- 帖子: 308
- 在线: 14小时
- 虫号: 320174
- 注册: 2007-03-10
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2008-12-04 19:50:25