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慕容仙尘

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于一些有序参数编程的问题 已有2人参与

最近看文献,用一些有序参数来表征分子结构,比如
关于一些有序参数编程的问题

这样的公式类在lammps里边是怎么编进去的呢?感觉有点无从下手
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

应该都是得到坐标后处理
3楼2016-11-29 10:08:58
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慕容仙尘

新虫 (初入文坛)

顶顶顶顶!!
2楼2016-11-29 09:01:49
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likun_2008

铁杆木虫 (正式写手)

这个公式直接算不出来,有序参数还有一个张量的矩阵表达式,你先通过软件计算出来每个时间点的所有分子的长轴单位矢量,再代入公式就可以算出来了

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4楼2016-11-29 11:57:45
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慕容仙尘

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by abinitio at 2016-11-29 10:08:58
应该都是得到坐标后处理

也就是说用lammps计算完体系之后,导出所有原子坐标吗?
5楼2016-11-29 14:27:48
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慕容仙尘

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by likun_2008 at 2016-11-29 11:57:45
这个公式直接算不出来,有序参数还有一个张量的矩阵表达式,你先通过软件计算出来每个时间点的所有分子的长轴单位矢量,再代入公式就可以算出来了

请问是什么软件?lammps可以实现吗?
6楼2016-11-29 14:28:38
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likun_2008

铁杆木虫 (正式写手)

我用的是gromacs,不知道lammps能不能实现,但是和ms都是一个类型的,应该可以吧

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7楼2016-11-29 14:51:51
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likun_2008

铁杆木虫 (正式写手)

参考文献:基于混合液晶分子动力学模拟比较液晶分子旋转粘度大小

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8楼2016-11-29 15:05:14
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jiezhou5322

银虫 (正式写手)

楼主现在解决了???我也想研究 界面分子取向
每个人只能陪你走一段路程
9楼2016-11-29 15:20:32
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jiezhou5322

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by abinitio at 2016-11-29 10:08:58
应该都是得到坐标后处理

请问,这个有具体的方法吗?
每个人只能陪你走一段路程
10楼2016-11-29 15:20:59
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