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NCBI中序列编号有非XP开头的,其代表什么意思?怎么来的? 已有1人参与
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| NCBI中序列编号有XP开头的代表的是转录组测出来的,那其他编号代表什么意思?怎么来的?望大神指点!! |
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ACCESSION MOLECULE METHOD NOTE AC_123456 Genomic Mixed 一些可供选择的注释的基因组序列,主要用来标记病毒和原核生物。 AP_123456 Protein Mixed AC_标记序列对应的蛋白产物。 NC_123456 Genomic Mixed 完整的基因组分子序列,标记的类别包括基因组、染色体、细胞器、质粒。 NG_123456 Genomic Mixed 不完整的基因组区域,提供NCBI基因组注释途径。比较有代表性有不转录的假基因或者那些很难自行化注释的基因组簇。 NM_123456 NM_123456789 mRNA Mixed 转录产物序列;成熟mRNA转录本序列。 NP_123456 NP_123456789 Protein Mixed 蛋白产物;主要是全长转录氨基酸序列,但也有一些只有部分蛋白质的部分氨基酸序列。 NR_123456 RNA Mixed 非编码的转录子序列,包括结构RNAs,假基因转子等。 NT_123456 Genomic Automated BAC或者鸟枪测序法的还未完全注释的测序序列。 NW_123456 NW_123456789 Genomic Automated BAC或者鸟枪测序法的还未完全注释的测序序列。 NZ_ABCD12345678 Genomic Automated 收集的各种利用鸟枪法测序的测序计划,ABCD代表的是计划的名称。 XM_123456 XM_123456789 mRNA Automated 转录产物;mRNA来自基因组注释,序列相当于基因组重叠群。 XP_123456 XP_123456789 Protein Automated 蛋白产物。序列相当于基因组重叠群。 XR_123456 RNA Automated 转录产物;非编码区来自基因组注释,序列相当于基因组重叠群。 YP_123456 YP_123456789 Protein Mixed 蛋白产物。不涉及到转录,主要用来标记细菌、病毒和线粒体。 ZP_12345678 Protein Automated 蛋白产物,主要是用电脑自动注释。 NS_123456 Genomic Automated 未知生物分子基因组序列。 |

2楼2016-11-25 09:26:50










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