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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何进行基因组序列比对，求相关的资料
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莫等闲111

版主 (知名作家)

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[求助] 如何进行基因组序列比对，求相关的资料

如何进行基因组序列比对（在PUBMED中)，求相关的资料，谢谢，感激不尽
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1楼 2016-11-23 21:54:04
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enjoy大志

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
1楼: Originally posted by 莫等闲111 at 2016-11-23 21:54:04
如何进行基因组序列比对（在PUBMED中)，求相关的资料，谢谢，感激不尽

NCBI—BLAST就可以进行碱基序列的比对。

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付出定有回报
2楼2016-11-23 22:35:03
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莫等闲111

版主 (知名作家)

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引用回帖:
2楼: Originally posted by enjoy大志 at 2016-11-23 22:35:03
NCBI—BLAST就可以进行碱基序列的比对。
...

这个说的太简单了，我也知道，有没有具体一点的步骤
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3楼2016-11-24 09:35:06
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君恋多

新虫 (小有名气)
有很多生物信息学软件可以做，比如lastz，mauve, mumer等等。。都是在linux下命令行进行操作的。如果是细菌基因组的话，也有一些在线比对的网站可以用。

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4楼2016-11-24 13:18:27
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mailmrcai

铜虫 (正式写手)
比较两个物种基因组序列的话，最好还是用NCBI这种在线的服务器，本地PC估计吃不消，内容太大。打开https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PROGRAM=blastn&PAGE_TYPE=BlastSearch&LINK_LOC=blasthome，勾选“Align two or more sequence”，在两个输入框输入两个基因组的ID就可以了
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Comeon！
5楼2016-11-25 22:20:20
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LX55

新虫 (初入文坛)
请问我只测出单向序列，因为时间问题没有再测互补序列，我需要去比对，但是为什么在Blast里面比对显示没有结果呢？是因为不是全序列吗？

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6楼2017-05-02 00:43:55
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牛牛。

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 君恋多 at 2016-11-24 13:18:27
有很多生物信息学软件可以做，比如lastz，mauve, mumer等等。。都是在linux下命令行进行操作的。如果是细菌基因组的话，也有一些在线比对的网站可以用。

您好，细菌基因组在线比对的网站有哪些呀
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7楼2021-06-17 22:17:10
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