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xtmgah31

银虫 (小有名气)

[交流] 酶切分型

最近做试验很不顺利,我都快崩溃了,老板追着要结果,烦啊!我要分析土样的微生物群落多样性,建立了16S rDNA文库,现在要对阳性克隆的PCR产物进行限制性酶切分型(OTUs),请问PCR产物直接酶切吗,还是要跑电泳回收?还有就是限制性酶是根据什么来选择的?请大家帮忙,让我早日摆脱苦海!

[ Last edited by 350784478 on 2009-11-6 at 20:39 ]
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fancy868


lwf991229(金币+1,VIP+0):感谢参与讨论~
我用通用型的回收试剂盒也直接回收过pcr产物,后续的实验表明没什么问题。不过,也可以先回收。只是听说有的胶可能会致使粘性末端的丢失。
5楼2008-12-15 12:18:39
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

★ ★
lwf991229(金币+2,VIP+0):感谢参与讨论~
最好是经过胶回收,或者清洁过的
否则残留的Taq酶、dNTP等会干扰酶切
内切酶可以参考文献大家用过哪些酶
其实也没有什么特别的规定的
2楼2008-12-03 12:05:04
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hihoney

铁杆木虫 (职业作家)


回收之后才能酶切。。
3楼2008-12-03 12:29:42
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xtmgah31

银虫 (小有名气)

好的,我试试,希望有好的结果!谢谢大家
4楼2008-12-03 13:42:36
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