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zcsxnb99

新虫 (初入文坛)

[求助] 求教大神 已有2人参与

我已经对晶体切面，建立了超晶胞，并且建立了真空层，如下图，下面我要进行加辅料小分子，具体怎么做？计算添加辅料小分子后得吸附能，是不是用Adsorption locator 模块？还是直接复制粘贴进去？下面是建立的超晶胞和辅料小分子。

求教大神


求教大神-1


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1楼 2016-11-18 21:07:09
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

cyfjkf

至尊木虫 (著名写手)
拷贝，粘贴，再稍微移动一下。

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zcsxnb99
5楼2016-11-21 07:03:50
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星夜空寂

木虫 (正式写手)

asdfghjkl
我是自己画上去的。

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3楼2016-11-19 01:51:14
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leebrave

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

利用AC/layer工具可以实现吧，但操作需要一定技巧。 吸附能是相互作用能的一种，需设计好自己的思路，最后计算利用加减法算出来。
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不慌，平常心，一步一步走过来。
9楼2016-11-22 09:19:22
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普通回帖

zcsxnb99

新虫 (初入文坛)
求助，大神们

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2楼2016-11-18 21:47:04
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阝东lalala

新虫 (小有名气)
请教下，我需要模拟的一个晶体的角度是90.6 94 103，请问这样该如何切晶胞便于md模拟呢？

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4楼2016-11-20 01:19:18
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zcsxnb99

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by cyfjkf at 2016-11-21 07:03:50
拷贝，粘贴，再稍微移动一下。

大神，然后呐，使用哪个模块进行分析计算晶体生长面上的吸附能和吸附构象，具体操作如何？大神

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6楼2016-11-21 14:25:29
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zcsxnb99

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 阝东lalala at 2016-11-20 01:19:18
请教下，我需要模拟的一个晶体的角度是90.6 94 103，请问这样该如何切晶胞便于md模拟呢？

不大清楚啊

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7楼2016-11-21 14:25:50
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阝东lalala

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by zcsxnb99 at 2016-11-21 14:25:50
不大清楚啊
...

你是怎么切的呢？我队晶体不是特别了解

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8楼2016-11-22 00:32:23
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zcsxnb99

新虫 (初入文坛)
继续顶

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10楼2016-11-23 19:24:16
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