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cynjau金虫 (小有名气)
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[求助]
如何利用多基因构建系统进化树 已有1人参与
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请教大家，看有些文献构建细菌的遗传进化树时，利用多个基因，16S，gyrB,aroE等10个基因构建的。不知道这个多基因构建进化树如何做，还请有指导的点拨一下。 难道就是把每个菌的对于基因序列连在一起作为一个fasta？然后按照一个基因那样做？ 还请知道的不吝赐教，十分感谢！ |
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cynjau: 金币+25 2016-12-11 12:55:14
cynjau: 金币+25 2016-12-11 12:55:38
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cynjau: 金币+25 2016-12-11 12:55:14
cynjau: 金币+25 2016-12-11 12:55:38
| 把所有的基因放在一个文本文档里就好了，你可以看看我写的这个http://wenku.baidu.com/view/0156 ... 7284b73f242336c31fe，如果没有MEGA的话，可以用Clustalx在线建树也可以的 |
2楼2016-11-15 18:07:48
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一般有两种思路: 1:你要把每个基因单独比对，然后用软件去除比对质量不高的区域，把得到的序列再进行合并，再建树;2:每个基因单独比对建树，再把树合并。理论上讲第二种最可靠，但是目前也没有看到有什么文献是这样做的。如果有别的虫友知道，还望告知。 发自小木虫Android客户端 |
3楼2016-11-16 00:06:48
