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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 在线答疑:Wien2k的问题
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wuli8

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csfn(金币+10,VIP+0):专帖主辛苦了，平安小红包慰劳:-)
引用回帖:
Originally posted by lsllsllsl at 2008-12-7 11:24:
我昨天用IF9和MKL8编译

大概也是你这个问题。

用PGI编译，只出现8个小的make clean问题，

所以就用PGI了，

不知道有什么不好的影响。。。

你用的是什么操作系统？
谢谢！
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…………
11楼2008-12-07 14:08:27
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lsllsllsl

木虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
wuli8(金币+2,VIP+0):感谢您的交流！(*^__^*) ……
wuchenwf(金币+2,VIP+0):xiexie
Red Hat Enterprise Linux 5.0

我也是帮别人装WIEN2K

以前从来没用过

所以，也不知道怎样测试，呵呵
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12楼2008-12-07 17:07:38
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wax54

铜虫 (小有名气)
★
wuli8(金币+1,VIP+0):新帖开张，提问有奖！(*^__^*) 嘻嘻……
ｇｈｏｓｔｂａｎｄｓ都去掉了，为什么还不能继续算下去呢？
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13楼2008-12-07 21:12:27
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wuli8

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wuchenwf(金币+6,VIP+0):xiexie
wax54  发的编译过程：

应管理员的要求，我准备把wien2k在amd架构服务器上整个的编译过程与大家分享。希望可以对初接触wien的虫友一些帮助。在下其实也刚刚接触，能力有限，错误之处还望各位多多指正。另外，由于本人对wien2k的程序还不熟悉，也希望就计算过程中出现的问题与大家多多交流。
1、系统的安装
    因为要用服务器搭建一个简单的集群，为了参考车静光老师的《微机集群组建、优化和管理》，所以决定选用suse linux。我用的是enterprise sever x86-64版。设置需要安装软件的时候，即使全部选中也还有很多的package没有安装。这时，可以按detail键，选择package group在其中查找gunplot，将其选中，否这运行wien2k的时候无法显示态密度图。
2、编译器的安装
    我选择了pgi的编译器7.0所谓的tbe版，不知道是不是破解版，还没有过15天。安装起来比较容易，将过程略去。
3、Mpich2的安装
    安装之前执行export FC=pgf90 CC=pgcc FFLAGS="-mcmodel=medium" CFLAGS=="-mcmodel=medium" CCFLAGS=="-mcmodel=medium" RSHCOMMAND=rsh
    mkdir /where_you_install_mpich2
   ./configure -prefix=/where_you_install_mpich2
    make
    make install
    PS：安装结束别忘记声明
4、数学库的安装
     数学库的选择颇为麻烦。听说对于amd的平台，pgi+libgoto运算最快。对数学库不熟悉的我最初尝试了用intel的ifort，icc和intel的mkl。我发现mkl的设置非常麻烦，尤其9和10架构有较大的差异，导致很难编译成功（尽管我参考了那篇著名的《Compiling Wien2k on Intel based systems with Suse Linux》）。按照Fecher的建议，我选择了mkl9，但是设置并行的时候还需要自己从网上下载blacs，scalapack等等，编译起来非常麻烦，极有可能设置错误。mkl10包含了scalapack,但是userguide对结构的介绍让人头疼。后来参考了一位网友编译的例子（对不起，现在找不到那篇帖子了，无法指名出处），感觉编译过程中参数设置非常奇怪，即使编译通过，运算过程还是出现错误。后来我发现了张挺的一篇关于上海超级计算中心编译wien2k的文章，按照上面的介绍，我选择了amd的核心数学库acml3.1，不过为了方便并减少可能出错的环节，我选择了amdscalapck3.1。这两个数学库安装起来相当容易，没有了繁琐的makefile的设置过程，只要install就可以了。
5、编译过程
     gunzip *.gz
     chmod +X ./expand_lapw
    ./expand_lapw (由于这三个过程都非常容易，略过)
    下面我重点说下./siteconfig_lapw
    系统的选择 ：选择L (linux+pgi )
    接下来的设置非常容易，基本选择默认的设置就可以。需要指出的是，在设置LDFLAGS时，最好给出绝对路径。我试了几次没有给出决定路径，总是提示找不到blas或者lapack。
    接下来是并行过程的设置。如果虫友的计算环境是单台多cpu的工作站或者服务器，shared memory一项选择y，接下来选择y和mpif90。如果为集群，可以选择n，rsh，y和mpif90。
    下面最重要的RP_LIBS的设置。我起初按照张挺文章上的设置，编译过程总是抱错。我后来在compile message中发现出错可能和RP_LIBS中设置的顺序有关（只是感觉，不知是否正确）。以下是我的具体参数设置（我将数学库和编译起都安装在了/opt目录中）：  /opt/acml3.1.0/pgi64/lib/libscalapack.a /opt/acml3.1.0/pgi64/lib/libacml.a /opt/acml3.1.0/pgi64/lib/libblacsF77init.a /opt/acml3.1.0/pgi64/lib/libblacsCinit.a /opt/acml3.1.0/pgi64/lib/libblacs.a
6、编译
     选择编译全部的程序，编译过程可能持续10几分钟。
结语
    按照上述编译过程我在集群上试验了TiC的例子，计算成功。然而对于LaSrMnO的例子在计算至lapw2时候始终失败，可能是我对程序不够熟悉，部分参数设置有误吧。计算过程中我一直选择的是k点并行，因为我的集群只有40个核心。mpi并行不知道是否设置成功，欢迎大家多多提供信息。
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14楼2008-12-08 10:15:16
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wuli8

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求助的问题2：
求：Wien2k 8.3
谢谢

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-21 at 09:56 ]
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15楼2008-12-08 10:56:48
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wuli8

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问：
引用回帖:
【求助】：如何安装wien2k，wien2k好用吗


如何安装wien2k

答：
引用回帖:
我在red hat 9.0和redhat enterprise 5下安装成功，不过先要设置好intel编译器的位置和使用权限：
[user@Linux wien]$ tar -xvf WIEN2k.tar
[user@Linux wien]$ gunzip *.gz
[user@Linux wien]$ chmod +x ./expand_lapw
[user@Linux wien]$ ./expand_lapw
[user@Linux wien]$ ./siteconfig
[user@Linux wien]$ w2web

问：
引用回帖:
请详细讲一下如何设置好intel编译器的位置和使用权限？
谢谢！！

答：
引用回帖:
我是这样做的，如果你是管理员，直接就将ifort的命令放到/bin目录下，那么就可以将ifort做为一个命令，其他用户都可以使用。如果是一般用户那得设置ifort的路径了，不然linux找不到。假设你是bash用户，那就可以修改你的.bash_profile，在里面加一句
         source 安装路径/ifortvars.sh
那么下次登陆的时候，就可以直接运行ifort了。不放心就编一个简单的fortran程序，测试一下就行了

引用回帖:
下面是一个简单的测试程序
program first
print *, "Hello World!"
end program first
编好后比如命名为first。f90
然后ifort first.f90 就会生成a.out
然后运行./a.out，当然你也可以生成指定的文件名例如
ifort -o first first.f90
运行之后文件名就是first了运行./first就可以了。
运行程序后如果显示Hello World!那就说明安装成功了

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-10 at 09:43 ]
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16楼2008-12-08 13:35:39
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引用回帖:
【求助】在wien2k这个软件这个软件中如何修改芯电子和价电子


在wien2k这个软件这个软件中如何修改芯电子和价电子
在初始化的过程中的那个步骤？
修改那个文件？
如何修改那些文件？
知道的告诉一下
谢谢

答：
引用回帖:
inc是芯电子，in2是价电子吧  



这个是正解，要去掉一个芯电子就将里面的数字修改一下就可以，但是你要确定该的是s还是p的。然后在in2中相应的将价电子数增加一下就可以了  

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-10 at 09:43 ]
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17楼2008-12-08 13:52:41
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引用回帖:
【求助】如何实现 wien2k lapw0并行计算
对 lapw0 的 编译通过

按照说明写入 lapw0 的 .machines 文件

直接  runsp_lapw -p ******* 运行提示 no match 错误

望高手指教

引用回帖:
在利用k点并行计算的时候
lapw0是不能并行的
但是lapw1和lapw2是可以并行的

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-10 at 09:42 ]
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18楼2008-12-08 13:55:41
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引用回帖:
【求助】如何画能带图

wien2k下哪个文件是用来画能带图的，如何将其导入到oginin里面画图

答：
引用回帖:
*.spaghettidn_ene
*.spaghettidn_ene
这两个文件是保存着用来画能带图的数据
在origin里打开
利用最后的两列
分别作为横坐标和纵坐标
就可以画出能带图了

[ Last edited by wuli8 on 2008-12-10 at 09:42 ]
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19楼2008-12-08 13:57:13
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[求助]SUSE下安装wien2k

zt970831(金币+0,VIP+0):发帖后请您到置顶目录帖按照格式登记，有奖励，谢谢！：）

SUSE下安装wien2k， intel fortran 10.0和mkl10.0都安装好了，但编译的时候有很多错误，我觉得可能是linking or library 设置得不对，有没有哪位高手给详细指点一下该怎么设置，本人新手，对linux还不熟悉。

答：
引用回帖:
  fortran 和mkl装好了还不行的，你要把他们的路径加进去才行。具体怎么加附件里有详细的说明，你看看吧，我也是网上看到的，希望有所帮助。http://muchong.com/bbs/attachment.php?aid=405864&checkid=d8cc7&download=1
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20楼2008-12-08 13:59:36
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