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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 想知道一个蛋白质的尺寸大小
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zzymjp

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] 想知道一个蛋白质的尺寸大小

本人最近在做一些实验，要使用蛋白质。我想知道干扰素-γ这个蛋白质的尺寸，有没有相关的数据。重谢。查了一些蛋白质库，看不懂。谁能帮一下忙替我查一下干扰素-γ这个蛋白质的尺寸。是尺寸，不是分子量。重谢
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1楼 2016-11-09 21:44:03
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lixin123qq

木虫 (小有名气)

小小博士
★ ★ ★ ★ ★
zzymjp: 金币+5 2016-11-10 17:06:44
pdb数据库里，看结构，测量尺度！

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2楼2016-11-10 01:27:30
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闲来小译

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zzymjp: 金币+5 2016-11-10 17:09:18
差不多2.6 x 3.0 x 6.0 nm吧
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3楼2016-11-10 06:17:05
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zzymjp

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lixin123qq at 2016-11-10 01:27:30
pdb数据库里，看结构，测量尺度！

我看不太懂那个，他有一个a,b,c对应的值还有角度α、β、γ，能教一下什么意思吗？
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4楼2016-11-10 17:07:57
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zzymjp

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 闲来小译 at 2016-11-10 06:17:05
差不多2.6 x 3.0 x 6.0 nm吧

有具体的文献吗？能教教我怎么查吗。pdb里面有一个a,b,c对应的值还有角度α、β、γ，能教一下什么意思吗？
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5楼2016-11-10 17:08:55
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lixin123qq

木虫 (小有名气)

小小博士
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by zzymjp at 2016-11-10 17:08:55
有具体的文献吗？能教教我怎么查吗。pdb里面有一个a,b,c对应的值还有角度α、β、γ，能教一下什么意思吗？...

这个是晶胞的大小，不是你说的尺寸，用pymol软件，看pdb结构，百度一下吧

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6楼2016-11-10 18:35:17
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gengxin60
★
zzymjp: 金币+1 2016-11-11 10:12:21
祝福
7楼2016-11-10 19:02:17
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xiaoLifeiD

至尊木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zzymjp: 金币+3, DLS吗，可是那是测颗粒的水合尺寸的啊，蛋白不太好弄吧 2016-11-11 10:08:45
很简单，用纳米粒度仪测一下

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8楼2016-11-10 21:31:09
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闲来小译

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zzymjp: 金币+5, 好的呢，十分感谢。 2016-11-11 10:15:22
引用回帖:
5楼: Originally posted by zzymjp at 2016-11-10 17:08:55
有具体的文献吗？能教教我怎么查吗。pdb里面有一个a,b,c对应的值还有角度α、β、γ，能教一下什么意思吗？...

我是用pymol测的。pdb里面的是晶胞参数，因为蛋白长成晶体之后才能衍射解结构，所以尺寸和角度数据是蛋白晶体最小单位－晶胞的参数。文献很少有描述蛋白尺寸的，因为并不是很重要。
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9楼2016-11-10 23:14:18
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