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xjuwshi

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】在模拟HOMO-LUMO轨道时如果结构中存在孤对电子该如何处理?

各位虫友,我有两个比较菜的问题:
1. 按前面一个帖子中各位所传授的方法来画HOMO和LUMO图时(先打开*.chk文件再用surface画出图形)是否就是默认为基于B3LYP算法?
2.当分子结构式中含有孤对电子时,运算时经常报错,此时是否直接将基组中的诸如“LP=****”的字眼删除即可?我自己试时删掉后就可以过了,但不知道这样算出的结果是否正确? 我以文献中报道的相同结构化合物为参照时画出的结果和文献不能相符,这个问题该如何解决哪?
不胜感激!
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喝白的,用啤的下酒
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erylingjet

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
xjuwshi(金币+5,VIP+0):谢谢帮助!
1    如果你就是用b3lyp计算的,那肯定就是了

2    最好贴出你的输入文件,看多重度是否有错?
2楼2008-12-01 18:50:58
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xjuwshi

木虫 (正式写手)

谢谢楼上的帮助。
我具体的作法是这样的:首先在chemdraw中画出分子式,然后paste到chem3D中保存得到高斯导入文件。
我昨晚又试了一下,发现在chem3D中原来就有关于Gaussian Interfaces的优化计算,在这里可以选取DFT-B3LYP的模式,估计在这里优化后Gaussian就能对孤对电子进行识别了。可是计算时间真是够长的,昨晚一个并不太复杂的分子式搞了两个多小时都没完成,不知道我这样的想法是否真确?想周末找个空机子再从头到尾试一下。
喝白的,用啤的下酒
3楼2008-12-02 10:29:52
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