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永恒的隐者

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助:chk 文件转换为fchk 文件遇到的问题 已有1人参与

我在服务器上将得到的chk文件用“formchk”命令转化为fchk文件,显示如下
$ formchk 1.chk 1.fchk
Read checkpoint file 1.chk
Write formatted file 1.fchk
FChkPn:  Coordinates translated and rotated.
FChkPn:  Coordinates match /B/ after translation and rotation.

也能生成fchk文件,但是用Gview打开出错,不知如何解决,请大神指点?
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小范范1989

木虫 (著名写手)

计算频率的fchk吗?
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
2楼2016-11-09 14:24:35
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永恒的隐者

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小范范1989 at 2016-11-09 14:24:35
计算频率的fchk吗?

我当时是优化构型计算频率同时进行的,
3楼2016-11-10 08:45:57
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小范范1989

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 永恒的隐者 at 2016-11-10 08:45:57
我当时是优化构型计算频率同时进行的,...

可能频率的就这样吧,我记得我算频率的也是打不开,可以看输出文件啊

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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
4楼2016-11-10 15:52:42
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不取俗名

木虫 (正式写手)

试试在本机上跑个单点,再用高斯转,有时候是会有这样的问题

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2016-11-10 20:00:03
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永恒的隐者

铁虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小范范1989 at 2016-11-10 15:52:42
可能频率的就这样吧,我记得我算频率的也是打不开,可以看输出文件啊
...

非常感谢!
我想通过Gview得到HOMO LUMO 图。接下来不计算频率我再试试看。
6楼2016-11-11 08:50:02
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永恒的隐者

铁虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 不取俗名 at 2016-11-10 20:00:03
试试在本机上跑个单点,再用高斯转,有时候是会有这样的问题

多谢指点!
你的意思是先把初始构型算单点,然后再优化构型。那第一步的单点计算和后面的高斯优化有什么联系呢?能否讲的更清楚一些呢
7楼2016-11-11 09:07:03
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永恒的隐者

铁虫 (小有名气)

我刚才没有加“freq”关键词,得到.chk文件后转换为fchk文件,得到的fchk文件用Gview还是打不开呢
当时在服务器上会出现以下信息:

$ formchk c.chk c.fchk
Read checkpoint file c.chk
Write formatted file c.fchk
FChkPn:  Initial coordinates match /B/.
8楼2016-11-11 09:28:19
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czyzsu

专家顾问 (文坛精英)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼主在linux下的文件是不是用unix2dos转换成windows下的文件,试试吧!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

9楼2016-11-11 16:23:16
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永恒的隐者

铁虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by czyzsu at 2016-11-11 16:23:16
楼主在linux下的文件是不是用unix2dos转换成windows下的文件,试试吧!

多谢回复!
我只是想用Gview得到某个分子的HOMO LUMO图,没有用过unix2dos命令,不过可以试试看。
10楼2016-11-13 17:11:18
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