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gwdavid木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
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[交流]
【求助】请帮忙解释一段关于分子动力学的英文！
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If the ligand poses predicted by docking is in the binding pocket determined by the PMF, then the downward slope would ensure a quick convergence of this initial configuration to the actual one in MD simulations. The binding free energies determined from MD simulations will also provide a check on the accuracy of those obtained from docking. 这段话是文献上的，是说用分子动力学优化autodock给出的对接结果，我不太明白。主要是上面两个标红的地方，PMF是什么，它能算结合自由能？分子动力学软件gromacs在模拟这样的受配体复合物时，也能计算其结合自由能吗？请帮忙！ [ Last edited by cadick on 2009-12-11 at 02:05 ] |
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