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丫丫2016

银虫 (正式写手)

[求助] 基因组甲基化(MSAP)的选扩问题

MSAP,现在做了一轮预扩增了,要进行选择性扩增了,但是要合成那些选择性扩增的引物呢?两种酶(EcoR I 和HpaII /MspI)的选择性扩增引物该怎么筛选?

我的两段预扩增引物分别是:
EcoR I 引物:GACTGCGTACCAATTC;
HpaII /MspI引物:ATCATGAGTCCTGCTCGG。
那么,有以下几个问题:
1、EcoR I 的选择性引物 是不是在预扩引物后面直接加两个碱基就行了? 这两个碱基的组合方式有16种,是不是每一种都要尝试,然后根据后面的聚丙烯酰胺凝胶电泳来筛选比较好的?(一般是在预扩引物后面加几个碱基呢?看文献看不懂,都看晕了。。)
2、HpaII /MspI 的选择性引物一般是在HpaII /MspI 预扩增引物后面加3个还是4个碱基呢???(或者加2个碱基也行??)是不是也是每一种都要去尝试?

谢谢大家的关注~!!!期待你的帮助!!!@biostar2009@wizardfan@youlinglyw@飞约疯人院
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遨游科研世界的小鱼
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ann?sen

新虫 (小有名气)

引用回帖:
1楼: Originally posted by 丫丫2016 at 2016-11-04 20:13:20
MSAP,现在做了一轮预扩增了,要进行选择性扩增了,但是要合成那些选择性扩增的引物呢?两种酶(EcoR I 和HpaII /MspI)的选择性扩增引物该怎么筛选?

我的两段预扩增引物分别是:
EcoR I 引物:GACTGCGTACCAAT ...

你好,现在我遇到你当年选扩引物合成方面的困惑,你是怎样解决的呢?

发自小木虫IOS客户端
2楼2018-07-10 16:59:08
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