24小时热门版块排行榜    

查看: 2596  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zb3ynf

银虫 (初入文坛)

[求助] vasp环境变量libmkl_intel_lp64.so找不到问题 已有2人参与

请教大家,我之前成功安装好的vasp软件可以正常运行,但是在我安装了另一个计算软件后,就不能运行了,一直提示vasp: error while loading shared libraries: libmkl_intel_lp64.so: cannot open shared object file: No such file or directory,然而ldd vasp可以找到相关的链接,如下
linux-vdso.so.1 =>  (0x00007fffa83ff000)
        libmkl_intel_lp64.so => /opt/intel/cmkl/10.2.7.041/lib/em64t/libmkl_intel_lp64.so (0x00002b1beda0f000)
        libmkl_sequential.so => /opt/intel/cmkl/10.2.7.041/lib/em64t/libmkl_sequential.so (0x00002b1bedf10000)
        libmkl_core.so => /opt/intel/cmkl/10.2.7.041/lib/em64t/libmkl_core.so (0x00002b1bee846000)
        libpthread.so.0 => /lib64/libpthread.so.0 (0x0000003178e00000)
        libguide.so => /opt/intel/cmkl/10.2.7.041/lib/em64t/libguide.so (0x00002b1beed26000)
        libmpi_f90.so.1 => /opt/openmpi/lib/libmpi_f90.so.1 (0x00002b1beeef7000)
        libmpi_f77.so.1 => /opt/openmpi/lib/libmpi_f77.so.1 (0x00002b1bef0fa000)
        libmpi.so.1 => /opt/openmpi/lib/libmpi.so.1 (0x00002b1bef32e000)
        libdl.so.2 => /lib64/libdl.so.2 (0x0000003178200000)
        libm.so.6 => /lib64/libm.so.6 (0x0000003178a00000)
        librt.so.1 => /lib64/librt.so.1 (0x0000003179600000)
        libnsl.so.1 => /lib64/libnsl.so.1 (0x000000318ac00000)
        libutil.so.1 => /lib64/libutil.so.1 (0x0000003188200000)
        libc.so.6 => /lib64/libc.so.6 (0x0000003178600000)
        libgcc_s.so.1 => /lib64/libgcc_s.so.1 (0x000000317ea00000)
        /lib64/ld-linux-x86-64.so.2 (0x0000003177e00000)
        libifport.so.5 => /opt/intel/Compiler/11.1/080/lib/intel64/libifport.so.5 (0x00002b1bef6d0000)
        libifcore.so.5 => /opt/intel/Compiler/11.1/080/lib/intel64/libifcore.so.5 (0x00002b1bef80a000)
        libimf.so => /opt/intel/Compiler/11.1/080/lib/intel64/libimf.so (0x00002b1befa81000)
        libsvml.so => /opt/intel/Compiler/11.1/080/lib/intel64/libsvml.so (0x00002b1befe15000)
        libintlc.so.5 => /opt/intel/Compiler/11.1/080/lib/intel64/libintlc.so.5 (0x00002b1bf002c000)
        libifcoremt.so.5 => /opt/intel/Compiler/11.1/080/lib/intel64/libifcoremt.so.5 (0x00002b1bf016a000)
环境变量设置应该没问题,但是运行vasp就是提示找不到,但是vasp在root下可以运行,请问各位这是什么问题?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
??N????????? computing node ?h??????c server node ?????
?????????? server node ????? library ??^???

echo $LD_LIBRARY_PATH

??????G vasp job ?r???? job script ?????????@??
?????GJOB??~ computing node ?????? library ????c server node ???
??????????????_?? VASP ??????????

?????@????????? job script ?????????? library path
4楼2016-11-03 17:56:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

souledge

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
说明Intel的环境变量只加到了root账户。而且当ldd vasp时也是使用的root账户。
思想重于技巧,内涵重于表象
2楼2016-11-03 12:19:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zb3ynf

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by souledge at 2016-11-03 12:19:38
说明Intel的环境变量只加到了root账户。而且当ldd vasp时也是使用的root账户。

不是的,使用的是普通用户ldd  bin/vasp
3楼2016-11-03 13:09:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 7lpolszZVXgi 2026-08-14 9/450 2026-08-15 17:46 by 7huP8NPKZCp9
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +27 医学老男孩 2026-08-13 58/2900 2026-08-15 15:57 by GZUZM
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 14:58 by QXtWNz7PI7wZ
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 3/150 2026-08-15 14:53 by QXtWNz7PI7wZ
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 3/150 2026-08-15 12:41 by KxMI1BYBxWX1
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 3/150 2026-08-15 12:33 by KxMI1BYBxWX1
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 07:09 by 4wMiSEwB6436
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
请填处理意见