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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 关于聚合物扩散系数模拟
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慕容仙尘

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于聚合物扩散系数模拟 已有1人参与

大家好，我现在再算聚合物的扩散系数，用MS-DISCOVER运行的，在NPT的条件下，使用pcff力场运行了1000ps，但是多次运行得到的MSD曲线斜率都不一样，差距还比较大，请问这是什么情况，应该怎么解决呢？
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1楼 2016-11-01 20:13:48
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
慕容仙尘: 金币+2, ★★★很有帮助 2016-11-09 14:28:31
先用NPT系综做平衡，然后算扩散系数时最好用NVE系综。斜率差别大不一定不合理。最后能得到百分之十的相对误差应该就差不多了。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2016-11-03 15:40:27
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慕容仙尘

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by brucefan at 2016-11-03 15:40:27
先用NPT系综做平衡，然后算扩散系数时最好用NVE系综。斜率差别大不一定不合理。最后能得到百分之十的相对误差应该就差不多了。

抱歉，刚看到您的回复。我现在是参考的一篇文献，他先用NVT做平衡，再在NPT下收集数据进行求解。那您说的NVE是不是可以在NPT之后求解呢？因为之前也算过NVE系综，感觉整体是一条平线，几乎没有斜率的样子
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3楼2016-11-07 12:34:25
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ms顺利用

新虫 (初入文坛)
您好 请问您找到解决方法了吗？发现问题到底是什么了吗？
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4楼2016-11-21 14:59:03
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慕容仙尘

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by ms顺利用 at 2016-11-21 14:59:03
您好 请问您找到解决方法了吗？发现问题到底是什么了吗？

很抱歉，我也没有合适的方法，现在还在探索

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5楼2016-11-21 22:41:03
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ms顺利用

新虫 (初入文坛)
好吧 还是谢谢你！

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6楼2016-11-22 15:18:17
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慕容仙尘

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by ms顺利用 at 2016-11-22 15:18:17
好吧 还是谢谢你！

希望可以随时交流！

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7楼2016-11-22 16:44:16
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Mr.wdouy

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 慕容仙尘 at 2016-11-07 12:34:25
抱歉，刚看到您的回复。我现在是参考的一篇文献，他先用NVT做平衡，再在NPT下收集数据进行求解。那您说的NVE是不是可以在NPT之后求解呢？因为之前也算过NVE系综，感觉整体是一条平线，几乎没有斜率的样子...

你好  请问参考的是哪篇文献呢？
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8楼2018-03-01 14:47:42
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