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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)

原子的椭球是没有问题的,特别是O的,没有问题,我现在就是不知道怎么加H,是哪一个当作水,哪一个当作羟基?因为只有定义羟基才会平衡电荷啊。
11楼2008-11-30 21:41:34
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级数收敛


warlen(金币+1,VIP+0):多谢应助!
金属离子的价态都确定了?
加氢两个办法:一个是差值傅立叶图上去找
另外一个是通过寻找可能的氢键来计算H的位置
引用回帖:
Originally posted by zhaoyangqufu at 2008-11-30 21:41:
原子的椭球是没有问题的,特别是O的,没有问题,我现在就是不知道怎么加H,是哪一个当作水,哪一个当作羟基?因为只有定义羟基才会平衡电荷啊。

12楼2008-11-30 22:02:35
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)

"另外一个是通过寻找可能的氢键来计算H的位置
"?我不太了解这个。可不可以加你QQ啊?请问你的QQ是多少?向你学习一下。
13楼2008-11-30 22:35:50
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

要做键价计算吧?
xi2004-emuch@163.com
14楼2008-11-30 22:54:40
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)

金属的价键计算我是通过pwt看的,所以金属的价态应该没错。请问xi2004还有其他的计算方法吗?我也是初学者,请赐教,谢谢。
15楼2008-12-01 08:45:33
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级数收敛

PLAN后面的数字变大,一般30左右是够了的,没必要弄到200
这样可以在差值傅立叶图上找到O附近0.85-1.00埃的残峰
如果这样的残峰很多,你可以用PLATON去计算O...A之间的距离
可以计算出潜在的氢键的,即哪些O....A之间的距离合适,中间会有一个H可能存在
这个calc full产生的platon.lst文件里面会有
好像用PARST计算也是会计算这个的
总之,就是编,编得越合理越好
引用回帖:
Originally posted by zhaoyangqufu at 2008-11-30 22:35:
"另外一个是通过寻找可能的氢键来计算H的位置
"?我不太了解这个。可不可以加你QQ啊?请问你的QQ是多少?向你学习一下。

16楼2008-12-01 11:01:04
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)

谢谢“级数收敛”!向你学习。
17楼2008-12-01 11:35:02
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