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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 羟基O和配位水的O怎么区分？
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)
原子的椭球是没有问题的，特别是O的，没有问题，我现在就是不知道怎么加H，是哪一个当作水，哪一个当作羟基？因为只有定义羟基才会平衡电荷啊。
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11楼2008-11-30 21:41:34
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级数收敛

★
warlen(金币+1,VIP+0):多谢应助！
金属离子的价态都确定了？
加氢两个办法：一个是差值傅立叶图上去找
另外一个是通过寻找可能的氢键来计算H的位置
引用回帖:
Originally posted by zhaoyangqufu at 2008-11-30 21:41:
原子的椭球是没有问题的，特别是O的，没有问题，我现在就是不知道怎么加H，是哪一个当作水，哪一个当作羟基？因为只有定义羟基才会平衡电荷啊。

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12楼2008-11-30 22:02:35
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)
"另外一个是通过寻找可能的氢键来计算H的位置
"?我不太了解这个。可不可以加你QQ啊？请问你的QQ是多少？向你学习一下。
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13楼2008-11-30 22:35:50
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
要做键价计算吧?
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xi2004-emuch@163.com
14楼2008-11-30 22:54:40
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)
金属的价键计算我是通过pwt看的，所以金属的价态应该没错。请问xi2004还有其他的计算方法吗？我也是初学者，请赐教，谢谢。
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15楼2008-12-01 08:45:33
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级数收敛

PLAN后面的数字变大，一般30左右是够了的，没必要弄到200
这样可以在差值傅立叶图上找到O附近0.85-1.00埃的残峰
如果这样的残峰很多，你可以用PLATON去计算O...A之间的距离
可以计算出潜在的氢键的，即哪些O....A之间的距离合适，中间会有一个H可能存在
这个calc full产生的platon.lst文件里面会有
好像用PARST计算也是会计算这个的
总之，就是编，编得越合理越好
引用回帖:
Originally posted by zhaoyangqufu at 2008-11-30 22:35:
"另外一个是通过寻找可能的氢键来计算H的位置
"?我不太了解这个。可不可以加你QQ啊？请问你的QQ是多少？向你学习一下。

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16楼2008-12-01 11:01:04
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)
谢谢“级数收敛”!向你学习。
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17楼2008-12-01 11:35:02
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