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荒唐的硬币

金虫 (小有名气)

[求助] RT-PCR得不到完整的cDNA扩增产物

情况是这样的,我目前在从mRNA扩增自己的目的基因(2.2K)。mRNA分别来自叶片和花芽。
最开始,用Oligo(dT)+Random引物做了反转录,之后用一对引物扩增cDNA,拿基因组DNA做阳性对照,上游引物在5‘端,下游引物在3’端,琼脂糖电泳,结果阳性对照有目的条带,我的cDNA都没有结果。
后来,设计了两对引物打算分两段扩增cDNA,琼脂糖电泳,结果对于两对引物,阳性对照有目的条带。而我的cDNA,只有后半段(靠近3‘端)有目的条带,前半段(靠近5’端)始终扩增不出来。
求助大神,有没有可能mRNA前半段并不存在?或者说反转录并没有得到完整的cDNA?
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