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JUJUNFENG

新虫 (小有名气)

[求助] 请问用T-RFLP技术处理样品后，怎么分析数据

最近做用T-RFLP技术测定了污染物对不同土壤细菌多样性的影响，但没有测序没有建库，得到的只是片段信息，而且也不打算建库了，得到数据后本小弱不会分析，根据查到的文献，对大概可以进行的分析总结了下，主要有香浓和辛普森指数分析，主成分分析，以及不同样品中细菌相似度的分析，另外还可以根据网上的比对信息推测细菌的种属，但不知道还有什么分析可以做？而且小弱以前没做过这个，数据分析的具体操作不懂唉，有没有虫友能提供帮助，推荐几款软件和网站啥的，在下感激不尽
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1楼 2016-10-22 12:38:23
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JUJUNFENG

新虫 (小有名气)
自己顶，别沉，还有个问题想补充下，算多样性之前需要将长度小于50bp，丰度小于1%的片段都去掉？还是只去掉小于50的片段就可以了，丰度小于1%的片段需要保留呢？
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2楼2016-10-22 14:04:44
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美亿美生物

捐助贵宾 (职业作家)

技术服务-实验代做

【答案】应助回帖

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
T-RFLP 的试验我们可以提供服务，关于分析大致也就您说的这些了。
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3楼2016-10-25 11:01:59
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JUJUNFENG

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 美亿美生物 at 2016-10-25 11:01:59
T-RFLP 的试验我们可以提供服务，关于分析大致也就您说的这些了。

谢谢！
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4楼2016-10-31 17:07:41
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