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暖暖032

新虫 (初入文坛)

[求助] 配置75%酒精纯化的原理和作用是什么? 已有1人参与

在proton平台前期建库过程中,配置75%酒精纯化的原理和作用是什么?如果是去除盐离子,怎么个去除法?求教有心人。
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winyuyuyu123

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-10-21 13:25:32
xn8008: 应助指数+1 2016-10-21 13:25:37
建库过程中有多个步骤会用到乙醇漂洗,如产物纯化步骤和目标大小片段筛选步骤。磁珠吸附法中,通过不同比例的磁珠Buffer可以选择性吸附目标大小的核酸,但此时溶液成分较为复杂,因为上一步的产物(如RT产物或者加接头的PCR产物)本身不够纯净,含有离子或酶等,且磁珠Buffer也含盐离子且有一定的毒性,因此在吸附核酸后需要漂洗。一般用70%或者75%乙醇漂洗磁珠,原因是75%乙醇能够溶解大部分盐离子,且核酸在这个浓度的乙醇中溶解度低,避免了核酸被洗脱(主要原因)。可以理解为:核酸倍吸附在磁珠上,原来的缓冲液很脏,倒掉后磁珠上及管壁等还有很多盐离子或蛋白等,用乙醇漂洗几次后,磁珠及离心管彻底纯净了,但还剩少部分未除尽的乙醇。此时需要彻底晾干磁珠,再加入dd水或TE Buffer,可溶解核酸并将其从磁珠上洗脱,去掉磁珠后即可获得纯净的核酸样本,用于后续上机测序。
2楼2016-10-21 13:07:48
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ybs1987

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by winyuyuyu123 at 2016-10-21 13:07:48
建库过程中有多个步骤会用到乙醇漂洗,如产物纯化步骤和目标大小片段筛选步骤。磁珠吸附法中,通过不同比例的磁珠Buffer可以选择性吸附目标大小的核酸,但此时溶液成分较为复杂,因为上一步的产物(如RT产物或者加接 ...

我想请问一下:核酸是在磁珠中高盐绑定,低盐洗脱的。乙醇去除了盐离子,核酸不会从磁珠上掉下来吗?虽然不溶于75%乙醇,但会呈悬浮状态,跟随乙醇被吸走?
悲哀
3楼2018-08-24 16:26:35
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