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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » Lammps总是报错 All masses are not set
汕头大学海洋科学接受调剂
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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)

[求助] Lammps总是报错 All masses are not set 已有2人参与

请教各位Lammps高手，自己运行in文件时，总是出现All masses are not set的错误，但自己已经将所有原子种类的质量设定了，报这个问题，还与什么有关系？

Lammps总是报错 All masses are not set
2016-10-19 17:07:29屏幕截图.png
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1楼 2016-10-19 17:08:31
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回帖置顶 ( 共有1个 )

oxox6085

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
胜利笑哈哈: 金币+15, ★有帮助 2016-10-26 21:50:32
smutao: 回帖置顶 2018-01-14 07:01:19
引用回帖:
3楼: Originally posted by 胜利笑哈哈 at 2016-10-23 15:20:35
感谢您的回复，按照您的提示修改in文件，还是有这个错误提示
对于您说的“看看哪一步提示的错误”，实在下面 velocity        boundary_layer set 0 0 0 units box  部分出现的错误，和手册中说的是一样的需要在velocity ...

如果data里设置了mass，in文件应该不用。 如果还是出现错误，尝试顺序：
mass * 63.546
velocity boundary_layer set 0 0 0
fix  1 all nve
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有些事情可能只有计算机模拟能告诉我们答案
4楼2016-10-24 01:03:34
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普通回帖

gredream

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
胜利笑哈哈: 金币+5, ★有帮助 2016-10-26 21:50:57
本帖内容被屏蔽
2楼2016-10-19 19:21:11
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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gredream at 2016-10-19 19:21:11
在in文件开始加echo screen，执行程序，看看哪一步提示的错误；
如果确认质量都设置了，请把mass移到creat atoms下面；

我在想，你都没有 生成42, 43原子；时候mass放之前是没有作用的；它是一次性执行命令，顺 ...

感谢您的回复，按照您的提示修改in文件，还是有这个错误提示
对于您说的“看看哪一步提示的错误”，实在下面 velocity        boundary_layer set 0 0 0 units box  部分出现的错误，和手册中说的是一样的需要在velocity之前将原子质量定义，现在很是郁闷，所有的data文件中，质量部分都是设置好了，单独拿出来进行弛豫，都是正常的，这合在一起就出现这毛病
Lammps总是报错 All masses are not set-1
2016-10-23 22:00:22屏幕截图.png
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3楼2016-10-23 22:20:35
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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by oxox6085 at 2016-10-24 01:03:34
如果data里设置了mass，in文件应该不用。 如果还是出现错误，尝试顺序：
mass * 63.546
velocity boundary_layer set 0 0 0
fix  1 all nve...

感谢您的建议，这几天有点小忙，没来得及给您回复
根据您的建议，调了顺序，但还是出现这种问题，不过偶然的机会在一个很小的程序里，也是出现这种同样的问题，这个程序只包含几种原子，于是将包括data文件中的原子，按顺序使用mass命令全部在in文件中列出，这个问题竟然给解决了，不知道是什么原因，这和手册中说的有点不一样。按照同样的方法，也在这个in文件中加入所有原子种类的mass命令，问题也同样解决了。
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5楼2016-10-26 21:50:05
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胜利笑哈哈

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gredream at 2016-10-19 19:21:11
在in文件开始加echo screen，执行程序，看看哪一步提示的错误；
如果确认质量都设置了，请把mass移到creat atoms下面；

我在想，你都没有 生成42, 43原子；时候mass放之前是没有作用的；它是一次性执行命令，顺 ...

感谢您的建议，问题已经解决
赞一下 回复此楼
6楼2016-10-26 21:51:18
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tina张

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 胜利笑哈哈 at 2016-10-26 21:51:18
感谢您的建议，问题已经解决...

您好!我想请教您一下，用readdata命令读多个data文件，data文件里原子序数用做改变么？
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不忘初心
7楼2016-11-07 17:03:09
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君君会发光

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by tina张 at 2016-11-07 17:03:09
您好!我想请教您一下，用readdata命令读多个data文件，data文件里原子序数用做改变么？...

同问！！！
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8楼2018-01-13 19:07:20
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