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汕头大学海洋科学接受调剂
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我pro求学路

铜虫 (小有名气)

[求助] 建立界面优化后 一侧原子不见了 已有2人参与

各位好,本人最近建立了A/B的界面。两者的错配是7%,当用ms build layer后优化(已经加了真空层),发现B侧的原子总会有部分不见了。将A B的位置互换,发现A的原子会有部分不见了。当调试display 中的Min ,不见的原子会再次出现。但是由此方法计算的界面能和粘结能就比较离谱了。请问这是怎么回事,有办法解决么,谢谢各位回答哈。
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ms建立界面

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温杨树

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

请问你建立界面的时候有没有调节界面间距,调节界面间距的时候是怎么调节的,用了Materials Studio的movement功能吗?如果用了这个功能,是不是选中A或者B的原子,然后向某个方向移动距离?如果有这个步骤,可能是你在移动选中原子之前的界面结构没有放正,就是没有用Materials Studio软件的View Onto或View across使界面的某一个面和xoy或xoz或yoz面平行且该面的某个边和某个坐标轴平行,导致向某个方向移动选中的原子时原子移出了界面结构,就看不到最边缘的那层原子了,你可以比较移动原子前后原子坐标位置变化,看看移动后是否有原子已经不在某个面上了。
4楼2017-06-30 10:30:42
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hzqwhyme

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
蛋蛋小童鞋: 金币+2, 谢谢参与,小木虫鼓励积极回答问题者 2016-11-21 20:11:30
不知道你的问题解决没有,我最近也在做界面,计算结合能之类的。  你可以试试impose symmtry 施加对称性试试,看看不见的原子会不会出现,然后再计算
2楼2016-11-21 20:01:09
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小该比

新虫 (初入文坛)

请问粘结能是怎么计算的

发自小木虫Android客户端
3楼2017-06-29 23:26:44
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yangych0801

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 温杨树 at 2017-06-30 10:30:42
请问你建立界面的时候有没有调节界面间距,调节界面间距的时候是怎么调节的,用了Materials Studio的movement功能吗?如果用了这个功能,是不是选中A或者B的原子,然后向某个方向移动距离?如果有这个步骤,可能是你 ...

应该是显示问题…

发自小木虫IOS客户端
要门儿活,要门儿死,绝不半死不活。
5楼2017-07-02 13:57:44
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