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lb1586551铜虫 (小有名气)
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【求助】关于怎么使用molekel 打开file.37画NBO轨道
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我使用guassian98做NBO分析得到了File.31-file.41,但是怎么用molekel也打不开file.37, [ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 19:28 ] |
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snoopyzhao
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jghe(金币+2,VIP+0):感谢你参与讨论！
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下面这个回复或许正对你的问题，当然，我本人没有试过。 这个回复来自于 CCL： I do not know if these programs are able to do this but Molekel shows this capability (www.cscs.ch/molekel) - at least the "old" version 4.3. You have to conduct the Gaussian03/NBO-calculation and include "pop=nboread" and "gfoldprint" in the input-section. After the molecule specification you have to add the following lines: $NBO plot $END which will be read by the built-in NBO-module. You will find several files in your directory after the calculation has finished. FILE.37 is the one with the NBOs. Then you have to modify the Gaussian03-Output slightly as described earlier on this list: Replace "Gaussian 03" by "Gaussian 98" in the lines following the Gaussian reference list: Before change: ****************************************** Gaussian 03: SYSTEM 13-Oct-2005 DATE ****************************************** After change: ***************************************** Gaussian 98: SYSTEM 13-Oct-2005 DATE ****************************************** Now, you can open the G03-output with molekel and choose in the menu "Load --> nbo orb" the respective FILE.37. The option "Compute --> Orbital" gives a menu where you can choose the desired orbital for visualization. Ordering is equivalent to the NBO-summary section in the Gaussian-Output. Hope this helps Ralf. |
2楼2008-11-26 20:08:51
spkeey
金虫 (正式写手)
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gwdavid(金币+4,VIP+0):谢谢你的回答，欢迎再次光临计算模拟版!
gwdavid(金币+4,VIP+0):谢谢你的回答，欢迎再次光临计算模拟版!
要使用老版本，5.3.0.6的最新版本去掉了对NBO轨道的支持。。 。不过是Molekel的一个飞跃。以前的版本是Linux的程序，在windows下的版本GUI用户界面不是很完善的。而5.3.0.6功能上 1可以打开的文件类型多了，2 图像变漂亮了3 但是简化了surface菜单和 calculate 菜单。专著于3D显示，而不是计算分析了。老版本，在windows下的版本没有5.3.0.6稳定，注意不要乱按键，不能用任何窗口上的关闭按钮。 [ Last edited by spkeey on 2008-11-27 at 10:26 ] |
3楼2008-11-27 10:16:59
