autodock对接精确性问题 - 分子模拟 - 其他 - 第2页小木虫论坛-学术科研互动平台

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铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:

10楼: Originally posted by changjun at 2016-10-24 12:22:35
同一名称的酶在PDB数据库里会有好多种，选择合适的酶很重要。另外，对接时的参数设置也会重要。
...

pdb文件选择都是选择分辨率高，没有缺失的，且原小分子大体类似我对接化合物结构的晶体pdb文件。只是个人感觉autodock不适合这种“化学结构类似，活性差异大，”的分析？我做其他酶筛选出来的活性化合物对接，结果（位点，能量）还可以。

11楼2016-10-24 13:51:10

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金虫 (初入文坛)

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

可能你的参数设置有问题

12楼2016-12-14 20:09:29

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